RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495399.1

C9orf135-204, Transcript of chromosome 9 open reading frame 135, humanhuman

TSL 2

Gene C9orf135, Length 502 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-204ENST00000495399 CFC1BP0CG36 223 aa4.33□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 CFC1P0CG37 223 aa4.33□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.33□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 C6orf99Q4VX62 202 aa4.33□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.33□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 HSD52Q0P140 79 aa4.32□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.32□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 A0A087X002 238 aa4.31□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0B4J2C4 111 aa4.31□□□□□ -1.72
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C9orf135-204ENST00000495399 SPRR4Q96PI1 79 aa4.31□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.31□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 COX7BP24311 80 aa4.3□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 A0A1B0GWB2 263 aa4.29□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 TPRXLQ17RH7 258 aa4.29□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.29□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.29□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.29□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 K7ERJ3 54 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 CTAG1AP78358 180 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 LINC00483Q53H64 154 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 RAB37Q96AX2 223 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.28□□□□□ -1.72
C9orf135-204ENST00000495399 H7C2G1 150 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 CRYGAP11844 174 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 CDIP1Q9H305 208 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.27□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 TSTD3H0UI37 97 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 LINC00575Q6W349 94 aa4.26□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 SPRR1BP22528 89 aa4.25□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.25□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.24□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 TRIAP1O43715 76 aa4.24□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 VAMP3Q15836 100 aa4.24□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 Q1RN00 199 aa4.24□□□□□ -1.73
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C9orf135-204ENST00000495399 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.23□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 SMIM29Q86T20 159 aa4.23□□□□□ -1.73
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C9orf135-204ENST00000495399 H0YGX0 51 aa4.22□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 M0R143 59 aa4.22□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 Q6ZQY7 126 aa4.22□□□□□ -1.73
C9orf135-204ENST00000495399 Q8N377 158 aa4.22□□□□□ -1.73
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C9orf135-204ENST00000495399 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.21□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.21□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 SLC25A20O43772 301 aa4.21□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 MOBPQ13875 183 aa4.21□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 CLEC2BQ92478 149 aa4.21□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 Q8NBF4 154 aa4.2□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 PSMB2P49721 201 aa4.19□□□□□ -1.74
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C9orf135-204ENST00000495399 A0A1B0GX51 115 aa4.18□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.18□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.18□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.18□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.18□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.18□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 A0A0G2JQZ4 141 aa4.17□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 COX6CP09669 75 aa4.17□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 LST1O00453 97 aa4.16□□□□□ -1.74
C9orf135-204ENST00000495399 TAX1BP3O14907 124 aa4.16□□□□□ -1.74
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C9orf135-204ENST00000495399 TRACP01848 142 aa4.15□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.15□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.15□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.15□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.14□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 H3BUT2 72 aa4.14□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 SNCGO76070 127 aa4.14□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 DNAL4O96015 105 aa4.13□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 SPINK1P00995 79 aa4.13□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.13□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 IGFL1Q6UW32 110 aa4.13□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.13□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.13□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 F8WEM9 126 aa4.12□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 CD164Q04900 197 aa4.12□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 A0A1W2PPM0 123 aa4.11□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 FABP2P12104 132 aa4.11□□□□□ -1.75
C9orf135-204ENST00000495399 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
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