RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 H0Y9J4 135 aa10.4□□□□□ -0.74
TOM1-216ENST00000492723 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
TOM1-216ENST00000492723 NREPQ16612 68 aa10.39□□□□□ -0.75
TOM1-216ENST00000492723 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa10.38□□□□□ -0.75
TOM1-216ENST00000492723 DNAH17Q9UFH2 4485 aa10.38□□□□□ -0.75
TOM1-216ENST00000492723 BCE1O60756 84 aa10.37□□□□□ -0.75
TOM1-216ENST00000492723 Q8NBF4 154 aa10.37□□□□□ -0.75
TOM1-216ENST00000492723 LINC00476Q8WZB0 136 aa10.37□□□□□ -0.75
TOM1-216ENST00000492723 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa10.36□□□□□ -0.75
TOM1-216ENST00000492723 CRYGAP11844 174 aa10.35□□□□□ -0.75
TOM1-216ENST00000492723 A0A0G2JQZ4 141 aa10.34□□□□□ -0.75
TOM1-216ENST00000492723 A0A1B0GW54 56 aa10.34□□□□□ -0.75
TOM1-216ENST00000492723 SERP2Q8N6R1 65 aa10.33□□□□□ -0.76
TOM1-216ENST00000492723 SPRR4Q96PI1 79 aa10.33□□□□□ -0.76
TOM1-216ENST00000492723 IGFL1Q6UW32 110 aa10.32□□□□□ -0.76
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa10.32□□□□□ -0.76
TOM1-216ENST00000492723 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.31□□□□□ -0.76
TOM1-216ENST00000492723 BPY2O14599 106 aa10.3□□□□□ -0.76
TOM1-216ENST00000492723 DNAH6Q9C0G6 4158 aa10.3□□□□□ -0.76
TOM1-216ENST00000492723 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.29□□□□□ -0.76
TOM1-216ENST00000492723 SPRR1BP22528 89 aa10.29□□□□□ -0.76
TOM1-216ENST00000492723 Q8N9L7 120 aa10.29□□□□□ -0.76
TOM1-216ENST00000492723 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.29□□□□□ -0.76
TOM1-216ENST00000492723 J3KT08 172 aa10.28□□□□□ -0.76
TOM1-216ENST00000492723 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.26□□□□□ -0.77
TOM1-216ENST00000492723 ALMS1Q8TCU4 4167 aa10.26□□□□□ -0.77
TOM1-216ENST00000492723 IGKV4-1P06312 121 aa10.24□□□□□ -0.77
TOM1-216ENST00000492723 DNAH8Q96JB1 4490 aa10.24□□□□□ -0.77
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP10-2P60368 255 aa10.22□□□□□ -0.77
TOM1-216ENST00000492723 FRAS1Q86XX4 4008 aa10.22□□□□□ -0.77
TOM1-216ENST00000492723 A0A087WSZ3 146 aa10.21□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 C5orf47Q569G3 176 aa10.2□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 DNAH11Q96DT5 4516 aa10.19□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 DNAH5Q8TE73 4624 aa10.19□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 HYDINQ4G0P3 5121 aa10.19□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 TMEM258P61165 79 aa10.18□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 RPS28P62857 69 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.16□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa10.16□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 ZNF861PO60384 105 aa10.16□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 DSCR10P59022 87 aa10.16□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 FAM30AQ9NZY2 134 aa10.16□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 DEFB116Q30KQ4 102 aa10.15□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TOM1-216ENST00000492723 OXTP01178 125 aa10.15□□□□□ -0.79
TOM1-216ENST00000492723 LINC00483Q53H64 154 aa10.14□□□□□ -0.79
TOM1-216ENST00000492723 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa10.13□□□□□ -0.79
TOM1-216ENST00000492723 K7EQZ3 153 aa10.13□□□□□ -0.79
TOM1-216ENST00000492723 FAT2Q9NYQ8 4349 aa10.12□□□□□ -0.79
TOM1-216ENST00000492723 PKD1P98161 4303 aa10.11□□□□□ -0.79
TOM1-216ENST00000492723 IGLV7-43P04211 117 aa10.1□□□□□ -0.79
TOM1-216ENST00000492723 C20orf197Q8N268 126 aa10.1□□□□□ -0.79
TOM1-216ENST00000492723 ANAPC11Q9NYG5 84 aa10.1□□□□□ -0.79
TOM1-216ENST00000492723 C4orf26Q17RF5 130 aa10.09□□□□□ -0.79
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP10-1P60331 282 aa10.09□□□□□ -0.79
TOM1-216ENST00000492723 MOBPQ13875 183 aa10.06□□□□□ -0.8
TOM1-216ENST00000492723 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
TOM1-216ENST00000492723 Q6ZSA8 131 aa10.05□□□□□ -0.8
TOM1-216ENST00000492723 HRCT1Q6UXD1 115 aa10.05□□□□□ -0.8
TOM1-216ENST00000492723 OCR1Q9BZK8 76 aa10.04□□□□□ -0.8
TOM1-216ENST00000492723 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.03□□□□□ -0.8
TOM1-216ENST00000492723 Q5XG85 94 aa10.02□□□□□ -0.81
TOM1-216ENST00000492723 HCG22E2RYF7 251 aa10.01□□□□□ -0.81
TOM1-216ENST00000492723 SNURFQ9Y675 71 aa10.01□□□□□ -0.81
TOM1-216ENST00000492723 KLKP1Q107X0 134 aa10□□□□□ -0.81
TOM1-216ENST00000492723 SACSQ9NZJ4 4579 aa10□□□□□ -0.81
TOM1-216ENST00000492723 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.98□□□□□ -0.81
TOM1-216ENST00000492723 H7BZZ5 65 aa9.97□□□□□ -0.81
TOM1-216ENST00000492723 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.97□□□□□ -0.81
TOM1-216ENST00000492723 A8MWP4 228 aa9.97□□□□□ -0.81
TOM1-216ENST00000492723 PRR15Q8IV56 129 aa9.96□□□□□ -0.82
TOM1-216ENST00000492723 TMEM254Q8TBM7 123 aa9.96□□□□□ -0.82
TOM1-216ENST00000492723 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa9.95□□□□□ -0.82
TOM1-216ENST00000492723 FAM236CP0DP71 79 aa9.95□□□□□ -0.82
TOM1-216ENST00000492723 Q96NJ1 140 aa9.93□□□□□ -0.82
TOM1-216ENST00000492723 LCE6AA0A183 80 aa9.91□□□□□ -0.82
TOM1-216ENST00000492723 NDUFC1O43677 76 aa9.91□□□□□ -0.82
TOM1-216ENST00000492723 NDUFB1O75438 58 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-216ENST00000492723 CASC2Q6XLA1 102 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-216ENST00000492723 PKHD1P08F94 4074 aa9.89□□□□□ -0.83
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.88□□□□□ -0.83
TOM1-216ENST00000492723 A0A0U1RQV1 116 aa9.88□□□□□ -0.83
TOM1-216ENST00000492723 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.87□□□□□ -0.83
TOM1-216ENST00000492723 LINC00336Q6ZUF6 198 aa9.86□□□□□ -0.83
TOM1-216ENST00000492723 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.85□□□□□ -0.83
TOM1-216ENST00000492723 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.85□□□□□ -0.83
TOM1-216ENST00000492723 A0A087X002 238 aa9.84□□□□□ -0.83
TOM1-216ENST00000492723 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.83□□□□□ -0.84
TOM1-216ENST00000492723 CDK2AP2O75956 126 aa9.81□□□□□ -0.84
TOM1-216ENST00000492723 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
TOM1-216ENST00000492723 CD164Q04900 197 aa9.81□□□□□ -0.84
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.81□□□□□ -0.84
TOM1-216ENST00000492723 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.8□□□□□ -0.84
TOM1-216ENST00000492723 hDV103S1A0JD37 113 aa9.8□□□□□ -0.84
TOM1-216ENST00000492723 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.79□□□□□ -0.84
TOM1-216ENST00000492723 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.79□□□□□ -0.84
TOM1-216ENST00000492723 A0A1B0GVX0 72 aa9.78□□□□□ -0.84
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.78□□□□□ -0.84
TOM1-216ENST00000492723 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
TOM1-216ENST00000492723 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.77□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 169 ms