RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492016.5

NELFCD-211, Transcript of negative elongation factor complex member C/D, humanhuman

TSL 2

Gene NELFCD, Length 606 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCD-211ENST00000492016 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.33□□□□□ -0.92
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NELFCD-211ENST00000492016 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFCD-211ENST00000492016 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
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NELFCD-211ENST00000492016 SMIM29Q86T20 159 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFCD-211ENST00000492016 MYCBP2O75592 4640 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFCD-211ENST00000492016 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.3□□□□□ -0.92
NELFCD-211ENST00000492016 A0A1W2PPM0 123 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFCD-211ENST00000492016 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.29□□□□□ -0.92
NELFCD-211ENST00000492016 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9.29□□□□□ -0.92
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NELFCD-211ENST00000492016 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
NELFCD-211ENST00000492016 UBE2V1Q13404 147 aa9.22□□□□□ -0.93
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NELFCD-211ENST00000492016 SPINK1P00995 79 aa9.19□□□□□ -0.94
NELFCD-211ENST00000492016 BAALC-AS2P0C853 105 aa9.19□□□□□ -0.94
NELFCD-211ENST00000492016 SPCS1Q9Y6A9 102 aa9.19□□□□□ -0.94
NELFCD-211ENST00000492016 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
NELFCD-211ENST00000492016 CD164Q04900 197 aa9.18□□□□□ -0.94
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NELFCD-211ENST00000492016 H3BMG7 143 aa9.16□□□□□ -0.94
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NELFCD-211ENST00000492016 H3BT86 120 aa9.14□□□□□ -0.95
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NELFCD-211ENST00000492016 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa9.12□□□□□ -0.95
NELFCD-211ENST00000492016 TNXBP22105 4242 aa9.12□□□□□ -0.95
NELFCD-211ENST00000492016 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa9.11□□□□□ -0.95
NELFCD-211ENST00000492016 RBM3P98179 157 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
NELFCD-211ENST00000492016 Q6Q795 121 aa9.09□□□□□ -0.95
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NELFCD-211ENST00000492016 Q5XG85 94 aa9.08□□□□□ -0.96
NELFCD-211ENST00000492016 TEN1Q86WV5 123 aa9.07□□□□□ -0.96
NELFCD-211ENST00000492016 A0A0G2JQZ4 141 aa9.06□□□□□ -0.96
NELFCD-211ENST00000492016 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa9.06□□□□□ -0.96
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NELFCD-211ENST00000492016 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.05□□□□□ -0.96
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NELFCD-211ENST00000492016 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa9.01□□□□□ -0.97
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NELFCD-211ENST00000492016 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9□□□□□ -0.97
NELFCD-211ENST00000492016 CCKP06307 115 aa8.99□□□□□ -0.97
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NELFCD-211ENST00000492016 C1orf195Q5TG92 126 aa8.92□□□□□ -0.98
NELFCD-211ENST00000492016 VPS25Q9BRG1 176 aa8.92□□□□□ -0.98
NELFCD-211ENST00000492016 HERC1Q15751 4861 aa8.92□□□□□ -0.98
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NELFCD-211ENST00000492016 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.79□□□□□ -1
NELFCD-211ENST00000492016 J3KT08 172 aa8.78□□□□□ -1
NELFCD-211ENST00000492016 NREPQ16612 68 aa8.77□□□□□ -1.01
NELFCD-211ENST00000492016 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.76□□□□□ -1.01
NELFCD-211ENST00000492016 IGKV4-1P06312 121 aa8.75□□□□□ -1.01
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NELFCD-211ENST00000492016 ACYP1P07311 99 aa8.71□□□□□ -1.02
NELFCD-211ENST00000492016 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFCD-211ENST00000492016 UBL5Q9BZL1 73 aa8.7□□□□□ -1.02
NELFCD-211ENST00000492016 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFCD-211ENST00000492016 Q6ZVQ6 151 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFCD-211ENST00000492016 LINC00846Q9NV44 126 aa8.69□□□□□ -1.02
NELFCD-211ENST00000492016 NDUFB1O75438 58 aa8.67□□□□□ -1.02
NELFCD-211ENST00000492016 C9orf92A6NGG3 77 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFCD-211ENST00000492016 A8MWP4 228 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFCD-211ENST00000492016 XP32Q5T750 250 aa8.66□□□□□ -1.02
NELFCD-211ENST00000492016 A0A1B0GVX0 72 aa8.65□□□□□ -1.02
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