RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491786.5

TTC7A-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC7A, Length 3,615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7A-211ENST00000491786 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
TTC7A-211ENST00000491786 A6NED7 52 aa7.57□□□□□ -1.2
TTC7A-211ENST00000491786 K7EIL1 84 aa7.56□□□□□ -1.2
TTC7A-211ENST00000491786 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.56□□□□□ -1.2
TTC7A-211ENST00000491786 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
TTC7A-211ENST00000491786 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.54□□□□□ -1.2
TTC7A-211ENST00000491786 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.54□□□□□ -1.2
TTC7A-211ENST00000491786 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.53□□□□□ -1.2
TTC7A-211ENST00000491786 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.53□□□□□ -1.2
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TTC7A-211ENST00000491786 LIMD2Q9BT23 127 aa7.53□□□□□ -1.2
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TTC7A-211ENST00000491786 Q75L30 129 aa7.5□□□□□ -1.21
TTC7A-211ENST00000491786 PRAC1Q96KF2 57 aa7.49□□□□□ -1.21
TTC7A-211ENST00000491786 B9D2Q9BPU9 175 aa7.49□□□□□ -1.21
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TTC7A-211ENST00000491786 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.48□□□□□ -1.21
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TTC7A-211ENST00000491786 PRLHP81277 87 aa7.44□□□□□ -1.22
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TTC7A-211ENST00000491786 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.42□□□□□ -1.22
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TTC7A-211ENST00000491786 C14orf177Q52M58 125 aa7.41□□□□□ -1.22
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TTC7A-211ENST00000491786 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.4□□□□□ -1.23
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TTC7A-211ENST00000491786 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
TTC7A-211ENST00000491786 K7EQZ3 153 aa7.38□□□□□ -1.23
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TTC7A-211ENST00000491786 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC7A-211ENST00000491786 SPINK7P58062 85 aa7.36□□□□□ -1.23
TTC7A-211ENST00000491786 DSCR10P59022 87 aa7.35□□□□□ -1.23
TTC7A-211ENST00000491786 MP68P56378 58 aa7.35□□□□□ -1.23
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TTC7A-211ENST00000491786 A0A087WSZ3 146 aa7.33□□□□□ -1.24
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TTC7A-211ENST00000491786 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.32□□□□□ -1.24
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TTC7A-211ENST00000491786 A0A1B0GW54 56 aa7.32□□□□□ -1.24
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TTC7A-211ENST00000491786 IGFL1Q6UW32 110 aa7.3□□□□□ -1.24
TTC7A-211ENST00000491786 CASC2Q6XLA1 102 aa7.29□□□□□ -1.24
TTC7A-211ENST00000491786 SPRR4Q96PI1 79 aa7.27□□□□□ -1.25
TTC7A-211ENST00000491786 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.27□□□□□ -1.25
TTC7A-211ENST00000491786 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.27□□□□□ -1.25
TTC7A-211ENST00000491786 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.26□□□□□ -1.25
TTC7A-211ENST00000491786 H0Y9P7 68 aa7.25□□□□□ -1.25
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TTC7A-211ENST00000491786 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.23□□□□□ -1.25
TTC7A-211ENST00000491786 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.23□□□□□ -1.25
TTC7A-211ENST00000491786 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TTC7A-211ENST00000491786 H0Y9J4 135 aa7.21□□□□□ -1.25
TTC7A-211ENST00000491786 PANO1I0J062 215 aa7.2□□□□□ -1.26
TTC7A-211ENST00000491786 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TTC7A-211ENST00000491786 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.19□□□□□ -1.26
TTC7A-211ENST00000491786 COL7A1Q02388 2944 aa7.19□□□□□ -1.26
TTC7A-211ENST00000491786 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TTC7A-211ENST00000491786 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.18□□□□□ -1.26
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TTC7A-211ENST00000491786 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TTC7A-211ENST00000491786 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.16□□□□□ -1.26
TTC7A-211ENST00000491786 RTL8CO15255 209 aa7.16□□□□□ -1.26
TTC7A-211ENST00000491786 H3BPC8 53 aa7.15□□□□□ -1.26
TTC7A-211ENST00000491786 PCOTHQ58A44 107 aa7.15□□□□□ -1.27
TTC7A-211ENST00000491786 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TTC7A-211ENST00000491786 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.14□□□□□ -1.27
TTC7A-211ENST00000491786 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TTC7A-211ENST00000491786 LY6G6CO95867 125 aa7.13□□□□□ -1.27
TTC7A-211ENST00000491786 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.13□□□□□ -1.27
TTC7A-211ENST00000491786 CDK2AP2O75956 126 aa7.13□□□□□ -1.27
TTC7A-211ENST00000491786 CSAG1Q6PB30 78 aa7.13□□□□□ -1.27
TTC7A-211ENST00000491786 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.13□□□□□ -1.27
TTC7A-211ENST00000491786 SPRR1BP22528 89 aa7.12□□□□□ -1.27
TTC7A-211ENST00000491786 A8MWP4 228 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC7A-211ENST00000491786 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.1□□□□□ -1.27
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