RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		6.33	□□□□□ -1.4
ERCC3-208	ENST00000491292		A8MU10	97 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		6.32	□□□□□ -1.4
ERCC3-208	ENST00000491292	TENM3	Q9P273	2699 aa		6.31	□□□□□ -1.4
ERCC3-208	ENST00000491292	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ERCC3-208	ENST00000491292	CHTF8	P0CG12	524 aa		6.3	□□□□□ -1.4
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERCC3-208	ENST00000491292		Q1T7F1	81 aa		6.28	□□□□□ -1.4
ERCC3-208	ENST00000491292	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	6.28	□□□□□ -1.4
ERCC3-208	ENST00000491292	PRR15	Q8IV56	129 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERCC3-208	ENST00000491292	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		6.27	□□□□□ -1.41
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ERCC3-208	ENST00000491292	LIMD2	Q9BT23	127 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ERCC3-208	ENST00000491292	TENM4	Q6N022	2769 aa		6.26	□□□□□ -1.41
ERCC3-208	ENST00000491292	COA5	Q86WW8	74 aa		6.25	□□□□□ -1.41
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1B0GW54	56 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ERCC3-208	ENST00000491292	SPRR4	Q96PI1	79 aa		6.24	□□□□□ -1.41
ERCC3-208	ENST00000491292	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP10-11	P60412	298 aa		6.23	□□□□□ -1.41
ERCC3-208	ENST00000491292		Q5VV11	94 aa		6.22	□□□□□ -1.41
ERCC3-208	ENST00000491292		H3BNG1	76 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		6.21	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	6.2	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	TNP2	Q05952	138 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	AKAP9	Q99996	3911 aa		6.2	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292		A8MWP4	228 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	C16orf90	A8MZG2	172 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	6.19	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		6.19	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	6.18	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	6.17	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		6.17	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	SPRR1A	P35321	89 aa		6.16	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		6.16	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	6.16	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	CD164	Q04900	197 aa		6.16	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		6.15	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		6.15	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		6.15	□□□□□ -1.42
ERCC3-208	ENST00000491292	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		6.15	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		6.14	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		6.14	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		6.14	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	MOBP	Q13875	183 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292		H3BPC8	53 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		6.13	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		6.12	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	LCA10	Q71F78	164 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	LCE6A	A0A183	80 aa		6.11	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	C14orf177	Q52M58	125 aa		6.1	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	SPINK7	P58062	85 aa		6.09	□□□□□ -1.43
ERCC3-208	ENST00000491292	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	6.08	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		6.08	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	TENM2	Q9NT68	2774 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	PRAC1	Q96KF2	57 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		6.07	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	SPINK1	P00995	79 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.06	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292		Q75L30	129 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292		K7EIL1	84 aa		6.05	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		6.04	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292	HRES1	P13985	223 aa		6.03	□□□□□ -1.44
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1B0GU69	56 aa		6.02	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A1B0GVX0	72 aa		6.02	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		6.02	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292	IGKV2-30	P06310	120 aa		6.01	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292	ACYP2	P14621	99 aa		6	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292	MDFI	Q99750	246 aa		6	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292	COL7A1	Q02388	2944 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292		A0A087X002	238 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292	PANO1	I0J062	215 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.99	□□□□□ -1.45
ERCC3-208	ENST00000491292	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC00313	P59037	77 aa		5.95	□□□□□ -1.46
ERCC3-208	ENST00000491292		A6NN06	94 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ERCC3-208	ENST00000491292	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		5.94	□□□□□ -1.46
ERCC3-208	ENST00000491292	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	5.94	□□□□□ -1.46
ERCC3-208	ENST00000491292	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.93	□□□□□ -1.46
ERCC3-208	ENST00000491292	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
ERCC3-208	ENST00000491292	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46

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