RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486862.1

OPTN-211, Transcript of optineurin, humanhuman

TSL 3

Gene OPTN, Length 423 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTN-211ENST00000486862 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
OPTN-211ENST00000486862 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.54□□□□□ -1.36
OPTN-211ENST00000486862 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.54□□□□□ -1.36
OPTN-211ENST00000486862 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.54□□□□□ -1.36
OPTN-211ENST00000486862 CDK2AP2O75956 126 aa6.54□□□□□ -1.36
OPTN-211ENST00000486862 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.54□□□□□ -1.36
OPTN-211ENST00000486862 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.54□□□□□ -1.36
OPTN-211ENST00000486862 PDE6GP18545 87 aa6.53□□□□□ -1.36
OPTN-211ENST00000486862 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
OPTN-211ENST00000486862 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.53□□□□□ -1.36
OPTN-211ENST00000486862 Q6ZQT0 140 aa6.52□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.52□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 DSCR8Q96T75 97 aa6.52□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 RYR1P21817 5038 aa6.51□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.51□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 CCKP06307 115 aa6.51□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 A0A1B0GV72 72 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 F8WEM9 126 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 ACYP1P07311 99 aa6.5□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 FAT1Q14517 4588 aa6.48□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.48□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 Q6JHZ5 121 aa6.47□□□□□ -1.37
OPTN-211ENST00000486862 A0A1B0GW54 56 aa6.46□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.46□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 IGFL1Q6UW32 110 aa6.46□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.45□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 HSPG2P98160 4391 aa6.45□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 A0A1W2PNM2 257 aa6.44□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 Q8NBF4 154 aa6.44□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 CDIP1Q9H305 208 aa6.44□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.44□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 FAM229AH3BQW9 127 aa6.43□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 Q6Q795 121 aa6.43□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.43□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.41□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 CRYGAP11844 174 aa6.41□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.41□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 LINC00846Q9NV44 126 aa6.41□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 MOBPQ13875 183 aa6.4□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.4□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 VPS25Q9BRG1 176 aa6.4□□□□□ -1.38
OPTN-211ENST00000486862 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 A0A0G2JQZ4 141 aa6.39□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.39□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 Q5VSD8 79 aa6.39□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.38□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 A0A087X002 238 aa6.38□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.37□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 CD164Q04900 197 aa6.37□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 LINC00643Q86TS7 51 aa6.37□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 Q8N1X5 172 aa6.37□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.37□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 UBL5Q9BZL1 73 aa6.36□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.35□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 Q6ZVQ6 151 aa6.34□□□□□ -1.39
OPTN-211ENST00000486862 A0A087WSZ3 146 aa6.33□□□□□ -1.4
OPTN-211ENST00000486862 NREPQ16612 68 aa6.32□□□□□ -1.4
OPTN-211ENST00000486862 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.31□□□□□ -1.4
OPTN-211ENST00000486862 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.31□□□□□ -1.4
OPTN-211ENST00000486862 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.31□□□□□ -1.4
OPTN-211ENST00000486862 SIGMAR1Q99720 223 aa6.31□□□□□ -1.4
OPTN-211ENST00000486862 MT-ATP8P03928 68 aa6.3□□□□□ -1.4
OPTN-211ENST00000486862 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.3□□□□□ -1.4
OPTN-211ENST00000486862 CXCL6P80162 114 aa6.29□□□□□ -1.4
OPTN-211ENST00000486862 Q5XG85 94 aa6.29□□□□□ -1.4
OPTN-211ENST00000486862 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.28□□□□□ -1.4
OPTN-211ENST00000486862 IMUPQ9GZP8 106 aa6.28□□□□□ -1.4
OPTN-211ENST00000486862 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.28□□□□□ -1.4
OPTN-211ENST00000486862 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.27□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.27□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.27□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.27□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 SPINK1P00995 79 aa6.26□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 BPY2O14599 106 aa6.25□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 KRTAP10-8P60410 259 aa6.25□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.25□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 Q96NJ1 140 aa6.25□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 LCE2CQ5TA81 110 aa6.24□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 HERC2O95714 4834 aa6.24□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 J3KT08 172 aa6.23□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 DSCR10P59022 87 aa6.23□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 LIMD2Q9BT23 127 aa6.23□□□□□ -1.41
OPTN-211ENST00000486862 TNXBP22105 4242 aa6.21□□□□□ -1.42
OPTN-211ENST00000486862 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.2□□□□□ -1.42
OPTN-211ENST00000486862 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
OPTN-211ENST00000486862 OXTP01178 125 aa6.19□□□□□ -1.42
OPTN-211ENST00000486862 IGKV4-1P06312 121 aa6.19□□□□□ -1.42
OPTN-211ENST00000486862 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.19□□□□□ -1.42
OPTN-211ENST00000486862 A8MWP4 228 aa6.18□□□□□ -1.42
OPTN-211ENST00000486862 SCGB1A1P11684 91 aa6.18□□□□□ -1.42
OPTN-211ENST00000486862 C1orf195Q5TG92 126 aa6.18□□□□□ -1.42
OPTN-211ENST00000486862 MT1HL1P0DM35 61 aa6.17□□□□□ -1.42
OPTN-211ENST00000486862 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
OPTN-211ENST00000486862 K7EQZ3 153 aa6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.8 ms