RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481600.5

EDRF1-208, Transcript of erythroid differentiation regulatory factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene EDRF1, Length 4,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1-208ENST00000481600 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
EDRF1-208ENST00000481600 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.69□□□□□ -1.18
EDRF1-208ENST00000481600 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.68□□□□□ -1.18
EDRF1-208ENST00000481600 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
EDRF1-208ENST00000481600 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
EDRF1-208ENST00000481600 C16orf90A8MZG2 172 aa7.67□□□□□ -1.18
EDRF1-208ENST00000481600 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.66□□□□□ -1.18
EDRF1-208ENST00000481600 IGKV2-30P06310 120 aa7.66□□□□□ -1.18
EDRF1-208ENST00000481600 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.66□□□□□ -1.18
EDRF1-208ENST00000481600 K7EQZ3 153 aa7.65□□□□□ -1.18
EDRF1-208ENST00000481600 TENM4Q6N022 2769 aa7.65□□□□□ -1.18
EDRF1-208ENST00000481600 C15orf56Q8N910 161 aa7.64□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 LIMD2Q9BT23 127 aa7.64□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.63□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.63□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 Q8N377 158 aa7.63□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 A0A0G2JQZ4 141 aa7.63□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.63□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 A0A1W2PNN7 141 aa7.63□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.63□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.63□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.62□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.62□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 KRTAP10-11P60412 298 aa7.6□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.59□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 VWFP04275 2813 aa7.59□□□□□ -1.19
EDRF1-208ENST00000481600 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.57□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 IGFL1Q6UW32 110 aa7.57□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 H3BPC8 53 aa7.57□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 RTL8CO15255 209 aa7.57□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 ERC2-IT1O76042 136 aa7.56□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.56□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 A8MWP4 228 aa7.55□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 K7EIL1 84 aa7.55□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 CASC10Q5T4H9 136 aa7.54□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 ACYP2P14621 99 aa7.54□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 A8MUN3 132 aa7.53□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 A0A1B0GU69 56 aa7.53□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 A0A1W2PNM2 257 aa7.52□□□□□ -1.2
EDRF1-208ENST00000481600 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
EDRF1-208ENST00000481600 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.51□□□□□ -1.21
EDRF1-208ENST00000481600 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.51□□□□□ -1.21
EDRF1-208ENST00000481600 LINC00313P59037 77 aa7.51□□□□□ -1.21
EDRF1-208ENST00000481600 PRR15Q8IV56 129 aa7.51□□□□□ -1.21
EDRF1-208ENST00000481600 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.49□□□□□ -1.21
EDRF1-208ENST00000481600 HIVEP1P15822 2718 aa7.48□□□□□ -1.21
EDRF1-208ENST00000481600 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.48□□□□□ -1.21
EDRF1-208ENST00000481600 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
EDRF1-208ENST00000481600 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.47□□□□□ -1.21
EDRF1-208ENST00000481600 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.46□□□□□ -1.21
EDRF1-208ENST00000481600 COA5Q86WW8 74 aa7.46□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 OCR1Q9BZK8 76 aa7.45□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.44□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.44□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.44□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.44□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.43□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 CD164Q04900 197 aa7.42□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 FAM229AH3BQW9 127 aa7.42□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.41□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 ZNF861PO60384 105 aa7.41□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 Q96NJ1 140 aa7.41□□□□□ -1.22
EDRF1-208ENST00000481600 A0A087WTM6 91 aa7.39□□□□□ -1.23
EDRF1-208ENST00000481600 A0A1B0GVX0 72 aa7.39□□□□□ -1.23
EDRF1-208ENST00000481600 Q1T7F1 81 aa7.39□□□□□ -1.23
EDRF1-208ENST00000481600 DSCR10P59022 87 aa7.38□□□□□ -1.23
EDRF1-208ENST00000481600 SPRR1AP35321 89 aa7.38□□□□□ -1.23
EDRF1-208ENST00000481600 C8orf87E5RJ46 101 aa7.38□□□□□ -1.23
EDRF1-208ENST00000481600 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
EDRF1-208ENST00000481600 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.37□□□□□ -1.23
EDRF1-208ENST00000481600 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.36□□□□□ -1.23
EDRF1-208ENST00000481600 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.36□□□□□ -1.23
EDRF1-208ENST00000481600 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
EDRF1-208ENST00000481600 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.35□□□□□ -1.23
EDRF1-208ENST00000481600 TENM3Q9P273 2699 aa7.35□□□□□ -1.23
EDRF1-208ENST00000481600 TNP2Q05952 138 aa7.34□□□□□ -1.24
EDRF1-208ENST00000481600 SPRR4Q96PI1 79 aa7.34□□□□□ -1.24
EDRF1-208ENST00000481600 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.33□□□□□ -1.24
EDRF1-208ENST00000481600 APLNQ9ULZ1 77 aa7.33□□□□□ -1.24
EDRF1-208ENST00000481600 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.32□□□□□ -1.24
EDRF1-208ENST00000481600 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.31□□□□□ -1.24
EDRF1-208ENST00000481600 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.31□□□□□ -1.24
EDRF1-208ENST00000481600 UQCR11O14957 56 aa7.29□□□□□ -1.24
EDRF1-208ENST00000481600 IGLV7-43P04211 117 aa7.29□□□□□ -1.24
EDRF1-208ENST00000481600 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
EDRF1-208ENST00000481600 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.26□□□□□ -1.25
EDRF1-208ENST00000481600 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.26□□□□□ -1.25
EDRF1-208ENST00000481600 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.26□□□□□ -1.25
EDRF1-208ENST00000481600 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
EDRF1-208ENST00000481600 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.23□□□□□ -1.25
EDRF1-208ENST00000481600 C9orf92A6NGG3 77 aa7.23□□□□□ -1.25
EDRF1-208ENST00000481600 Q5VV11 94 aa7.22□□□□□ -1.25
EDRF1-208ENST00000481600 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.21□□□□□ -1.25
EDRF1-208ENST00000481600 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.2□□□□□ -1.26
EDRF1-208ENST00000481600 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms