RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475302.1

ITGA6-210, Transcript of integrin subunit alpha 6, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA6, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6-210ENST00000475302 PKD1P98161 4303 aa5.95□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 A0A1B0GVY2 172 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.94□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.93□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 BCE1O60756 84 aa5.93□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 PRLHP81277 87 aa5.93□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.93□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 SMIM29Q86T20 159 aa5.93□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 SPRR1BP22528 89 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 UBE2BP63146 152 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.92□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 CCKP06307 115 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 Q6ZQT0 140 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 DPH3Q96FX2 82 aa5.91□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 ACYP1P07311 99 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.9□□□□□ -1.46
ITGA6-210ENST00000475302 SCXQ7RTU7 201 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 VPS25Q9BRG1 176 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 RYR2Q92736 4967 aa5.89□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.88□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 XGP55808 180 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 HIGD2AQ9BW72 106 aa5.87□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 A0A1B0GV72 72 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 PDE6GP18545 87 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.86□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF861PO60384 105 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 UBE2AP49459 152 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00846Q9NV44 126 aa5.85□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 MT-ATP8P03928 68 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 IGLV7-43P04211 117 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00483Q53H64 154 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 C1orf137Q5JT78 98 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 SPRR4Q96PI1 79 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 DSCR8Q96T75 97 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.84□□□□□ -1.47
ITGA6-210ENST00000475302 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
ITGA6-210ENST00000475302 A0A1W2PNM2 257 aa5.83□□□□□ -1.48
ITGA6-210ENST00000475302 SIGMAR1Q99720 223 aa5.83□□□□□ -1.48
ITGA6-210ENST00000475302 HAMPP81172 84 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00643Q86TS7 51 aa5.81□□□□□ -1.48
ITGA6-210ENST00000475302 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
ITGA6-210ENST00000475302 A0A1B0GW54 56 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA6-210ENST00000475302 Q6JHZ5 121 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA6-210ENST00000475302 IGFL1Q6UW32 110 aa5.79□□□□□ -1.48
ITGA6-210ENST00000475302 A0A0G2JQZ4 141 aa5.78□□□□□ -1.48
ITGA6-210ENST00000475302 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.78□□□□□ -1.48
ITGA6-210ENST00000475302 RYR3Q15413 4870 aa5.78□□□□□ -1.48
ITGA6-210ENST00000475302 Q8NBF4 154 aa5.78□□□□□ -1.48
ITGA6-210ENST00000475302 CRYGAP11844 174 aa5.77□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 Q6Q795 121 aa5.77□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 Q6ZVQ6 151 aa5.76□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 F8WEM9 126 aa5.74□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 IMUPQ9GZP8 106 aa5.74□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.74□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.73□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 SCGB1A1P11684 91 aa5.73□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 UBL5Q9BZL1 73 aa5.72□□□□□ -1.49
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.71□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.71□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 PKHD1P08F94 4074 aa5.7□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 CXCL6P80162 114 aa5.69□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.69□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 A0A087X002 238 aa5.68□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.68□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.68□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 MOBPQ13875 183 aa5.67□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 NREPQ16612 68 aa5.67□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.67□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.67□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 A0A087WSZ3 146 aa5.66□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.66□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 DSCR10P59022 87 aa5.65□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.65□□□□□ -1.5
ITGA6-210ENST00000475302 A0A087WVE0 104 aa5.64□□□□□ -1.51
ITGA6-210ENST00000475302 CDK2AP2O75956 126 aa5.64□□□□□ -1.51
ITGA6-210ENST00000475302 CD164Q04900 197 aa5.64□□□□□ -1.51
ITGA6-210ENST00000475302 Q96NJ1 140 aa5.64□□□□□ -1.51
ITGA6-210ENST00000475302 FAT1Q14517 4588 aa5.63□□□□□ -1.51
ITGA6-210ENST00000475302 BPY2O14599 106 aa5.62□□□□□ -1.51
ITGA6-210ENST00000475302 IGKV4-1P06312 121 aa5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms