RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469694.5

GPC1-208, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 2

Gene GPC1, Length 2,862 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-208ENST00000469694 SYCNQ0VAF6 134 aa8.89□□□□□ -0.99
GPC1-208ENST00000469694 APLNQ9ULZ1 77 aa8.89□□□□□ -0.99
GPC1-208ENST00000469694 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.89□□□□□ -0.99
GPC1-208ENST00000469694 C1orf137Q5JT78 98 aa8.88□□□□□ -0.99
GPC1-208ENST00000469694 Q8NBF4 154 aa8.88□□□□□ -0.99
GPC1-208ENST00000469694 TNP2Q05952 138 aa8.88□□□□□ -0.99
GPC1-208ENST00000469694 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.87□□□□□ -0.99
GPC1-208ENST00000469694 SPRR4Q96PI1 79 aa8.87□□□□□ -0.99
GPC1-208ENST00000469694 NDUFB1O75438 58 aa8.87□□□□□ -0.99
GPC1-208ENST00000469694 CD164Q04900 197 aa8.87□□□□□ -0.99
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GPC1-208ENST00000469694 A8MU10 97 aa8.86□□□□□ -0.99
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GPC1-208ENST00000469694 Q5VV11 94 aa8.85□□□□□ -0.99
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GPC1-208ENST00000469694 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.84□□□□□ -0.99
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GPC1-208ENST00000469694 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
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GPC1-208ENST00000469694 C16orf90A8MZG2 172 aa8.77□□□□□ -1.01
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GPC1-208ENST00000469694 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
GPC1-208ENST00000469694 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.7□□□□□ -1.02
GPC1-208ENST00000469694 LCA10Q71F78 164 aa8.7□□□□□ -1.02
GPC1-208ENST00000469694 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.7□□□□□ -1.02
GPC1-208ENST00000469694 A0A0G2JQZ4 141 aa8.69□□□□□ -1.02
GPC1-208ENST00000469694 A0A1W2PNN7 141 aa8.69□□□□□ -1.02
GPC1-208ENST00000469694 H3BPC8 53 aa8.69□□□□□ -1.02
GPC1-208ENST00000469694 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.69□□□□□ -1.02
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GPC1-208ENST00000469694 IGFL1Q6UW32 110 aa8.67□□□□□ -1.02
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GPC1-208ENST00000469694 CHTF8P0CG12 524 aa8.66□□□□□ -1.02
GPC1-208ENST00000469694 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.66□□□□□ -1.02
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GPC1-208ENST00000469694 A6NN06 94 aa8.64□□□□□ -1.03
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GPC1-208ENST00000469694 CASC2Q6XLA1 102 aa8.63□□□□□ -1.03
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GPC1-208ENST00000469694 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.53□□□□□ -1.04
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GPC1-208ENST00000469694 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.52□□□□□ -1.04
GPC1-208ENST00000469694 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.52□□□□□ -1.04
GPC1-208ENST00000469694 MOBPQ13875 183 aa8.52□□□□□ -1.05
GPC1-208ENST00000469694 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.52□□□□□ -1.05
GPC1-208ENST00000469694 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.51□□□□□ -1.05
GPC1-208ENST00000469694 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
GPC1-208ENST00000469694 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.5□□□□□ -1.05
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