RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PDE6GP18545 87 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRC-210ENST00000462363 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 REG3GQ6UW15 175 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM29Q86T20 159 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 SPRR1BP22528 89 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GV72 72 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PNM2 257 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZVQ6 151 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 DSCR8Q96T75 97 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GW54 56 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 SPRR4Q96PI1 79 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 RTL8CO15255 209 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 BCE1O60756 84 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 PRLHP81277 87 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 Q8NBF4 154 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRC-210ENST00000462363 LY6G6CO95867 125 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2BP63146 152 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 CXCL6P80162 114 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 UBL5Q9BZL1 73 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 A0A087WVE0 104 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 LCE6AA0A183 80 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 CRYGAP11844 174 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00483Q53H64 154 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf137Q5JT78 98 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZSA8 131 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 IGFL1Q6UW32 110 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 CCDC179H3BU77 68 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 PKHD1P08F94 4074 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 ATOX1O00244 68 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV4-1P06312 121 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0G2JQZ4 141 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 COX7CP15954 63 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 FAM30AQ9NZY2 134 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRC-210ENST00000462363 UQCRQO14949 82 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 UBE2AP49459 152 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 DSCR10P59022 87 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP10-1P60331 282 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 HAMPP81172 84 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 SERP2Q8N6R1 65 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF861PO60384 105 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 NREPQ16612 68 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 SCXQ7RTU7 201 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 F8WEM9 126 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 IGLV7-43P04211 117 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 Q8N9L7 120 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 BPY2O14599 106 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 Q96NJ1 140 aa3.37□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 RYR2Q92736 4967 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 A0A087WSZ3 146 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GVY2 172 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 OCR1Q9BZK8 76 aa3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 K7EQZ3 153 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 DPH3Q96FX2 82 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 MOBPQ13875 183 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
PTPRC-210ENST00000462363 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.34□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.1 ms