RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418800.6

DDR1-232, Transcript of discoidin domain receptor tyrosine kinase 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene DDR1, Length 3,588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1-232ENST00000418800 Q1T7F1 81 aa7.61□□□□□ -1.19
DDR1-232ENST00000418800 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.61□□□□□ -1.19
DDR1-232ENST00000418800 CD164Q04900 197 aa7.6□□□□□ -1.19
DDR1-232ENST00000418800 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.6□□□□□ -1.19
DDR1-232ENST00000418800 DSCR10P59022 87 aa7.6□□□□□ -1.19
DDR1-232ENST00000418800 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
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DDR1-232ENST00000418800 CASC2Q6XLA1 102 aa7.58□□□□□ -1.2
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DDR1-232ENST00000418800 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.53□□□□□ -1.2
DDR1-232ENST00000418800 REG3GQ6UW15 175 aa7.53□□□□□ -1.2
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DDR1-232ENST00000418800 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.49□□□□□ -1.21
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DDR1-232ENST00000418800 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
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DDR1-232ENST00000418800 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.27□□□□□ -1.25
DDR1-232ENST00000418800 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.25□□□□□ -1.25
DDR1-232ENST00000418800 LYSTQ99698 3801 aa7.25□□□□□ -1.25
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DDR1-232ENST00000418800 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
DDR1-232ENST00000418800 H3BS24 57 aa7.24□□□□□ -1.25
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DDR1-232ENST00000418800 C8orf87E5RJ46 101 aa7.23□□□□□ -1.25
DDR1-232ENST00000418800 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.23□□□□□ -1.25
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DDR1-232ENST00000418800 A0A1B0GU69 56 aa7.2□□□□□ -1.26
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DDR1-232ENST00000418800 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.2□□□□□ -1.26
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DDR1-232ENST00000418800 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.19□□□□□ -1.26
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DDR1-232ENST00000418800 DNHD1Q96M86 4753 aa7.15□□□□□ -1.26
DDR1-232ENST00000418800 C14orf177Q52M58 125 aa7.15□□□□□ -1.27
DDR1-232ENST00000418800 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
DDR1-232ENST00000418800 LINC01554Q52M75 96 aa7.14□□□□□ -1.27
DDR1-232ENST00000418800 PANO1I0J062 215 aa7.13□□□□□ -1.27
DDR1-232ENST00000418800 A0A087X002 238 aa7.12□□□□□ -1.27
DDR1-232ENST00000418800 ACYP2P14621 99 aa7.12□□□□□ -1.27
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