RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.3□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.3□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 B5MCH6 92 aa6.3□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 OXTP01178 125 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q6JHZ5 121 aa6.29□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMEM126AQ9H061 195 aa6.28□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.28□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.28□□□□□ -1.4
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGLV7-43P04211 117 aa6.27□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.27□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.26□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.26□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.25□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.25□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NCR3O14931 201 aa6.25□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MT1HL1P0DM35 61 aa6.25□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.25□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q8NDZ9 215 aa6.25□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TNXBP22105 4242 aa6.25□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATOX1O00244 68 aa6.24□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CCKP06307 115 aa6.24□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 VPREB1P12018 145 aa6.24□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.24□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.23□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 REG3GQ6UW15 175 aa6.23□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.23□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 H0Y9J4 135 aa6.22□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 H3BQ85 93 aa6.22□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UQCRQO14949 82 aa6.22□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LCE3BQ5TA77 95 aa6.22□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00846Q9NV44 126 aa6.22□□□□□ -1.41
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C6orf99Q4VX62 202 aa6.21□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.21□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00575Q6W349 94 aa6.21□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DIRC1Q969H9 104 aa6.21□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.2□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BCE1O60756 84 aa6.2□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COX7CP15954 63 aa6.2□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 hADV29S1A0JD25 119 aa6.19□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF861PO60384 105 aa6.19□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGLV6-57P01721 117 aa6.19□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.18□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.18□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.18□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.18□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.18□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.16□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.16□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 M0R378 163 aa6.16□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.16□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBE2AP49459 152 aa6.16□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRLHP81277 87 aa6.16□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.16□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBL5Q9BZL1 73 aa6.16□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CRYGAP11844 174 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PDE6GP18545 87 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP10-8P60410 259 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q6ZQT0 140 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SERP2Q8N6R1 65 aa6.15□□□□□ -1.42
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.14□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COX7BP24311 80 aa6.14□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.13□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A087WVE0 104 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRYO14603 147 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q6ZQY7 126 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SVIPQ8NHG7 77 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DSCR8Q96T75 97 aa6.12□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LCE4AQ5TA78 99 aa6.1□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.1□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A087X002 238 aa6.09□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPRR1AP35321 89 aa6.09□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.09□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.09□□□□□ -1.43
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.08□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.08□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMEM258P61165 79 aa6.08□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q6ZVQ6 151 aa6.08□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 J3KT08 172 aa6.07□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CXCL6P80162 114 aa6.07□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.04□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q6ZRX8 168 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.03□□□□□ -1.44
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPRR4Q96PI1 79 aa6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms