RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 CASC10Q5T4H9 136 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 NDUFS5O43920 106 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 DSCR10P59022 87 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 C15orf56Q8N910 161 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 B9D2Q9BPU9 175 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 Q8NBF4 154 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 Q9BRP9 147 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 PRR34Q9NV39 138 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRN-202ENST00000409251 H0Y9P7 68 aa8.34□□□□□ -1.08
PTPRN-202ENST00000409251 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRN-202ENST00000409251 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRN-202ENST00000409251 Q6ZRX8 168 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRN-202ENST00000409251 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRN-202ENST00000409251 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRN-202ENST00000409251 PRR15Q8IV56 129 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRN-202ENST00000409251 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRN-202ENST00000409251 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRN-202ENST00000409251 CASC2Q6XLA1 102 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRN-202ENST00000409251 UBE2AP49459 152 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRN-202ENST00000409251 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRN-202ENST00000409251 Q1T7F1 81 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRN-202ENST00000409251 NDUFB1O75438 58 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRN-202ENST00000409251 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRN-202ENST00000409251 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRN-202ENST00000409251 Q5VV11 94 aa8.25□□□□□ -1.09
PTPRN-202ENST00000409251 IGFL1Q6UW32 110 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRN-202ENST00000409251 C16orf90A8MZG2 172 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRN-202ENST00000409251 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRN-202ENST00000409251 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRN-202ENST00000409251 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.22□□□□□ -1.09
PTPRN-202ENST00000409251 REG3GQ6UW15 175 aa8.21□□□□□ -1.09
PTPRN-202ENST00000409251 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PTPRN-202ENST00000409251 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 FBN3Q75N90 2809 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 COA5Q86WW8 74 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 H3BNG1 76 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 CHTF8P0CG12 524 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 CD164Q04900 197 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 LIMD2Q9BT23 127 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRN-202ENST00000409251 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.15□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 LCA10Q71F78 164 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 SPRR4Q96PI1 79 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 PRAC1Q96KF2 57 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 TNP2Q05952 138 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 CDK2AP2O75956 126 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 APLNQ9ULZ1 77 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRN-202ENST00000409251 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
PTPRN-202ENST00000409251 LY6G6CO95867 125 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRN-202ENST00000409251 SPINK7P58062 85 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRN-202ENST00000409251 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRN-202ENST00000409251 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRN-202ENST00000409251 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
PTPRN-202ENST00000409251 LCE6AA0A183 80 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRN-202ENST00000409251 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRN-202ENST00000409251 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRN-202ENST00000409251 KMT2AQ03164 3969 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRN-202ENST00000409251 A8MWP4 228 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRN-202ENST00000409251 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8□□□□□ -1.13
PTPRN-202ENST00000409251 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8□□□□□ -1.13
PTPRN-202ENST00000409251 A0A1B0GW54 56 aa8□□□□□ -1.13
PTPRN-202ENST00000409251 MOBPQ13875 183 aa8□□□□□ -1.13
PTPRN-202ENST00000409251 SPRR1AP35321 89 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRN-202ENST00000409251 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRN-202ENST00000409251 NUPR2A6NF83 97 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRN-202ENST00000409251 PANO1I0J062 215 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRN-202ENST00000409251 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRN-202ENST00000409251 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRN-202ENST00000409251 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRN-202ENST00000409251 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.96□□□□□ -1.13
PTPRN-202ENST00000409251 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRN-202ENST00000409251 Q75L30 129 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRN-202ENST00000409251 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRN-202ENST00000409251 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRN-202ENST00000409251 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRN-202ENST00000409251 HRES1P13985 223 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRN-202ENST00000409251 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRN-202ENST00000409251 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRN-202ENST00000409251 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRN-202ENST00000409251 A6NN06 94 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRN-202ENST00000409251 LINC00313P59037 77 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRN-202ENST00000409251 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms