RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 SNURFQ9Y675 71 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSCAO43653 123 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
APOBEC3G-201ENST00000407997 SYCNQ0VAF6 134 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q6ZQY7 126 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC3G-201ENST00000407997 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.52□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.52□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 COX7BP24311 80 aa6.52□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 BPY2O14599 106 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 DIRC1Q969H9 104 aa6.51□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A0U1RQV1 116 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRYO14603 147 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 PKD1P98161 4303 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 PKHD1P08F94 4074 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 C15orf56Q8N910 161 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 RYR1P21817 5038 aa6.5□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 C16orf90A8MZG2 172 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 C1orf195Q5TG92 126 aa6.49□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A1B0GW54 56 aa6.48□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDK2AP2O75956 126 aa6.48□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.48□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q8NDZ9 215 aa6.48□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 OCR1Q9BZK8 76 aa6.48□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 BRK1Q8WUW1 75 aa6.48□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.48□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.48□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 V9GYY9 64 aa6.48□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 TNP2Q05952 138 aa6.47□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.47□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGKV4-1P06312 121 aa6.46□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.46□□□□□ -1.37
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q6ZRU5 148 aa6.46□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.45□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 M0R378 163 aa6.43□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 C10orf25Q5T742 122 aa6.43□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCXQ7RTU7 201 aa6.43□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 PRR15Q8IV56 129 aa6.42□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 J3QL48 77 aa6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 HSPG2P98160 4391 aa6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q1T7F1 81 aa6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q8N1X5 172 aa6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.41□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 hDV103S1A0JD37 113 aa6.4□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 SEC61GP60059 68 aa6.4□□□□□ -1.38
APOBEC3G-201ENST00000407997 VPREB1P12018 145 aa6.39□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.39□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.39□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q6ZRP5 223 aa6.38□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.38□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.38□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.36□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A087WTM6 91 aa6.34□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 KRTAP10-2P60368 255 aa6.34□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q8N9L7 120 aa6.34□□□□□ -1.39
APOBEC3G-201ENST00000407997 NDUFB1O75438 58 aa6.33□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.33□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 PMAIP1Q13794 54 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 SMIM29Q86T20 159 aa6.32□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.31□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.31□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q8NBF4 154 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPRR4Q96PI1 79 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.29□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q8N377 158 aa6.28□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 C7orf33Q8WU49 177 aa6.28□□□□□ -1.4
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.27□□□□□ -1.41
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A096LNI7 61 aa6.27□□□□□ -1.41
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.26□□□□□ -1.41
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A1W2PNM2 257 aa6.26□□□□□ -1.41
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPRR1AP35321 89 aa6.26□□□□□ -1.41
APOBEC3G-201ENST00000407997 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.26□□□□□ -1.41
APOBEC3G-201ENST00000407997 REG3GQ6UW15 175 aa6.26□□□□□ -1.41
APOBEC3G-201ENST00000407997 H0Y9J4 135 aa6.25□□□□□ -1.41
APOBEC3G-201ENST00000407997 H3BPC8 53 aa6.25□□□□□ -1.41
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM229AH3BQW9 127 aa6.25□□□□□ -1.41
APOBEC3G-201ENST00000407997 C1orf137Q5JT78 98 aa6.25□□□□□ -1.41
APOBEC3G-201ENST00000407997 Q5VSD8 79 aa6.25□□□□□ -1.41
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.25□□□□□ -1.41
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