RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362817.1

RNU1-38P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-38P, Length 144 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-38P-201ENST00000362817 COX8AP10176 69 aa4.31□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 C6orf99Q4VX62 202 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.3□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 A6NDN8 102 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 DLEU1O43261 78 aa4.29□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 COX7BP24311 80 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPATA45Q537H7 98 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 C14orf144Q96I85 54 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.28□□□□□ -1.72
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 A4D1N5 150 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRR4Q16378 134 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q8NBF4 154 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 VAMP8Q9BV40 100 aa4.27□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1B0GWB2 263 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 CTAG1AP78358 180 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 MOBPQ13875 183 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 PYY3Q5JQD4 70 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 HIST1H4GQ99525 98 aa4.26□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPRR1BP22528 89 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 C12orf57Q99622 126 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 HIGD1BQ9P298 99 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 RNF213Q63HN8 5207 aa4.25□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.24□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRAC1Q96KF2 57 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 MUC17Q685J3 4493 aa4.23□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 SPINK1P00995 79 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 TAL2Q16559 108 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 LINC00575Q6W349 94 aa4.22□□□□□ -1.73
RNU1-38P-201ENST00000362817 CEND1Q8N111 149 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.21□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A0B4J2C4 111 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 VAMP3Q15836 100 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q1RN00 199 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q8N377 158 aa4.2□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 hADV29S1A0JD25 119 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 H7C2G1 150 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 SLC25A20O43772 301 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 FXYD2P54710 66 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 RAB37Q96AX2 223 aa4.19□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 TPRXLQ17RH7 258 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q6ZQY7 126 aa4.18□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 HSD52Q0P140 79 aa4.17□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.17□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRO1933Q9H354 126 aa4.17□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.17□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 MUC2Q02817 5179 aa4.17□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A0G2JQZ4 141 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.16□□□□□ -1.74
RNU1-38P-201ENST00000362817 CD164Q04900 197 aa4.15□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 H0YGX0 51 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 K7ERJ3 54 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.14□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 LIMD2Q9BT23 127 aa4.13□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 F8WEM9 126 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 DSCR10P59022 87 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q5XG85 94 aa4.12□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 A0A1B0GX51 115 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 SMIM6P0DI80 62 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 IGFL1Q6UW32 110 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 CLEC2BQ92478 149 aa4.11□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 Q6JHZ5 121 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.1□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 H3BUT2 72 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 SNCGO76070 127 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 PSMB2P49721 201 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 C1orf195Q5TG92 126 aa4.09□□□□□ -1.75
RNU1-38P-201ENST00000362817 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.08□□□□□ -1.76
RNU1-38P-201ENST00000362817 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
RNU1-38P-201ENST00000362817 COX6CP09669 75 aa4.07□□□□□ -1.76
RNU1-38P-201ENST00000362817 H3BMG7 143 aa4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.5 ms