RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 SPRR1BP22528 89 aa13.31□□□□□ -0.28
CTU2-201ENST00000312060 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa13.29□□□□□ -0.28
CTU2-201ENST00000312060 C3orf22Q8N5N4 141 aa13.28□□□□□ -0.28
CTU2-201ENST00000312060 LINC01600Q96MT4 127 aa13.28□□□□□ -0.28
CTU2-201ENST00000312060 LINC00483Q53H64 154 aa13.28□□□□□ -0.28
CTU2-201ENST00000312060 SMIM29Q86T20 159 aa13.27□□□□□ -0.29
CTU2-201ENST00000312060 ANAPC11Q9NYG5 84 aa13.27□□□□□ -0.29
CTU2-201ENST00000312060 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa13.27□□□□□ -0.29
CTU2-201ENST00000312060 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa13.21□□□□□ -0.29
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CTU2-201ENST00000312060 ETDBQ3ZM63 59 aa13.19□□□□□ -0.3
CTU2-201ENST00000312060 F8WEM9 126 aa13.18□□□□□ -0.3
CTU2-201ENST00000312060 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa13.18□□□□□ -0.3
CTU2-201ENST00000312060 TEN1Q86WV5 123 aa13.18□□□□□ -0.3
CTU2-201ENST00000312060 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa13.16□□□□□ -0.3
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CTU2-201ENST00000312060 RBM3P98179 157 aaKnown RBP13.15□□□□□ -0.3
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CTU2-201ENST00000312060 MOBPQ13875 183 aa13.1□□□□□ -0.31
CTU2-201ENST00000312060 DSCR8Q96T75 97 aa13.1□□□□□ -0.31
CTU2-201ENST00000312060 C14orf132Q9NPU4 83 aa13.1□□□□□ -0.31
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa13.08□□□□□ -0.31
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa13.08□□□□□ -0.31
CTU2-201ENST00000312060 Q8NBF4 154 aa13.07□□□□□ -0.32
CTU2-201ENST00000312060 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa13.05□□□□□ -0.32
CTU2-201ENST00000312060 Q6JHZ5 121 aa13.05□□□□□ -0.32
CTU2-201ENST00000312060 PRR26Q8N8Z3 221 aa13.05□□□□□ -0.32
CTU2-201ENST00000312060 IGFL1Q6UW32 110 aa13.05□□□□□ -0.32
CTU2-201ENST00000312060 FAT3Q8TDW7 4589 aa13.04□□□□□ -0.32
CTU2-201ENST00000312060 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
CTU2-201ENST00000312060 A0A0G2JQZ4 141 aa13.03□□□□□ -0.32
CTU2-201ENST00000312060 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa13.03□□□□□ -0.32
CTU2-201ENST00000312060 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CTU2-201ENST00000312060 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa13.02□□□□□ -0.32
CTU2-201ENST00000312060 PDE6GP18545 87 aa13.02□□□□□ -0.33
CTU2-201ENST00000312060 TYMSOSQ8TAI1 123 aa13.02□□□□□ -0.33
CTU2-201ENST00000312060 Q6ZQT0 140 aa13□□□□□ -0.33
CTU2-201ENST00000312060 CCKP06307 115 aa12.97□□□□□ -0.33
CTU2-201ENST00000312060 VPS25Q9BRG1 176 aa12.97□□□□□ -0.33
CTU2-201ENST00000312060 K7ERU9 68 aa12.96□□□□□ -0.33
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CTU2-201ENST00000312060 A0A1W2PNM2 257 aa12.95□□□□□ -0.34
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CTU2-201ENST00000312060 MYCBP2O75592 4640 aa12.93□□□□□ -0.34
CTU2-201ENST00000312060 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa12.93□□□□□ -0.34
CTU2-201ENST00000312060 J3QR89 54 aa12.92□□□□□ -0.34
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CTU2-201ENST00000312060 ACYP1P07311 99 aa12.79□□□□□ -0.36
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CTU2-201ENST00000312060 LINC00846Q9NV44 126 aa12.77□□□□□ -0.37
CTU2-201ENST00000312060 SS18L2Q9UHA2 77 aa12.73□□□□□ -0.37
CTU2-201ENST00000312060 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
CTU2-201ENST00000312060 LIMD2Q9BT23 127 aa12.71□□□□□ -0.37
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CTU2-201ENST00000312060 Q96NJ1 140 aa12.59□□□□□ -0.39
CTU2-201ENST00000312060 CDIP1Q9H305 208 aa12.59□□□□□ -0.39
CTU2-201ENST00000312060 C1orf195Q5TG92 126 aa12.57□□□□□ -0.4
CTU2-201ENST00000312060 BPY2O14599 106 aa12.54□□□□□ -0.4
CTU2-201ENST00000312060 LINC00643Q86TS7 51 aa12.54□□□□□ -0.4
CTU2-201ENST00000312060 SIGMAR1Q99720 223 aa12.54□□□□□ -0.4
CTU2-201ENST00000312060 IGKV4-1P06312 121 aa12.53□□□□□ -0.4
CTU2-201ENST00000312060 RETNLBQ9BQ08 111 aa12.51□□□□□ -0.41
CTU2-201ENST00000312060 J3KT08 172 aa12.51□□□□□ -0.41
CTU2-201ENST00000312060 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.48□□□□□ -0.41
CTU2-201ENST00000312060 SCGB1A1P11684 91 aa12.48□□□□□ -0.41
CTU2-201ENST00000312060 CXCL6P80162 114 aa12.47□□□□□ -0.41
CTU2-201ENST00000312060 DSCR10P59022 87 aa12.46□□□□□ -0.41
CTU2-201ENST00000312060 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa12.45□□□□□ -0.42
CTU2-201ENST00000312060 A8MWP4 228 aa12.42□□□□□ -0.42
CTU2-201ENST00000312060 NDUFB1O75438 58 aa12.41□□□□□ -0.42
CTU2-201ENST00000312060 MT-ATP8P03928 68 aa12.41□□□□□ -0.42
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