RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
CTSW-201ENST00000307886 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CTSW-201ENST00000307886 SMIM29Q86T20 159 aa8.35□□□□□ -1.07
CTSW-201ENST00000307886 Q1RN00 199 aa8.34□□□□□ -1.07
CTSW-201ENST00000307886 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.34□□□□□ -1.07
CTSW-201ENST00000307886 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.34□□□□□ -1.07
CTSW-201ENST00000307886 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.33□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 LCE2CQ5TA81 110 aa8.33□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.33□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 A0A0B4J2C4 111 aa8.32□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 VAMP3Q15836 100 aa8.32□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.32□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 A0A0G2JQZ4 141 aa8.31□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.31□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.3□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 A4D1N5 150 aa8.3□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 H3BUT2 72 aa8.3□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 FABP2P12104 132 aa8.3□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 UBE2V1Q13404 147 aa8.3□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.3□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 RAB37Q96AX2 223 aa8.3□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 LIMD2Q9BT23 127 aa8.3□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 A0A1W2PPM0 123 aa8.29□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 K7ERJ3 54 aa8.29□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 CFC1BP0CG36 223 aa8.29□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 CFC1P0CG37 223 aa8.29□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 CD164Q04900 197 aa8.29□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.29□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.29□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 C9orf92A6NGG3 77 aa8.29□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 Q5XG85 94 aa8.28□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.28□□□□□ -1.08
CTSW-201ENST00000307886 H7C2G1 150 aa8.27□□□□□ -1.09
CTSW-201ENST00000307886 PCOTHQ58A44 107 aa8.27□□□□□ -1.09
CTSW-201ENST00000307886 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.26□□□□□ -1.09
CTSW-201ENST00000307886 K7EP34 96 aa8.26□□□□□ -1.09
CTSW-201ENST00000307886 C1orf195Q5TG92 126 aa8.26□□□□□ -1.09
CTSW-201ENST00000307886 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.25□□□□□ -1.09
CTSW-201ENST00000307886 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.23□□□□□ -1.09
CTSW-201ENST00000307886 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.22□□□□□ -1.09
CTSW-201ENST00000307886 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.21□□□□□ -1.1
CTSW-201ENST00000307886 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
CTSW-201ENST00000307886 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CTSW-201ENST00000307886 COX6CP09669 75 aa8.19□□□□□ -1.1
CTSW-201ENST00000307886 MT1HP80294 61 aa8.19□□□□□ -1.1
CTSW-201ENST00000307886 LINC00575Q6W349 94 aa8.19□□□□□ -1.1
CTSW-201ENST00000307886 PSMB2P49721 201 aa8.18□□□□□ -1.1
CTSW-201ENST00000307886 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.17□□□□□ -1.1
CTSW-201ENST00000307886 F8W1H4 67 aa8.15□□□□□ -1.1
CTSW-201ENST00000307886 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
CTSW-201ENST00000307886 Q6ZQY7 126 aa8.13□□□□□ -1.11
CTSW-201ENST00000307886 hADV29S1A0JD25 119 aa8.12□□□□□ -1.11
CTSW-201ENST00000307886 TRIAP1O43715 76 aa8.12□□□□□ -1.11
CTSW-201ENST00000307886 ATXN8Q156A1 80 aa8.12□□□□□ -1.11
CTSW-201ENST00000307886 H3BMG7 143 aa8.11□□□□□ -1.11
CTSW-201ENST00000307886 TCL1BO95988 128 aa8.1□□□□□ -1.11
CTSW-201ENST00000307886 IGFL1Q6UW32 110 aa8.1□□□□□ -1.11
CTSW-201ENST00000307886 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.09□□□□□ -1.11
CTSW-201ENST00000307886 F8WEM9 126 aa8.07□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 H0YGX0 51 aa8.07□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.07□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.06□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 LST1O00453 97 aa8.06□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 Q6JHZ5 121 aa8.06□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 PRO0461Q9UI25 63 aa8.06□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 CLEC2BQ92478 149 aa8.05□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 TRACP01848 142 aa8.04□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 K7ERU9 68 aa8.03□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.03□□□□□ -1.12
CTSW-201ENST00000307886 C9JAW5 83 aa8.02□□□□□ -1.13
CTSW-201ENST00000307886 H3BT86 120 aa8.02□□□□□ -1.13
CTSW-201ENST00000307886 A0A1B0GX51 115 aa8.01□□□□□ -1.13
CTSW-201ENST00000307886 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.01□□□□□ -1.13
CTSW-201ENST00000307886 J3QR89 54 aa8□□□□□ -1.13
CTSW-201ENST00000307886 SNCGO76070 127 aa8□□□□□ -1.13
CTSW-201ENST00000307886 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8□□□□□ -1.13
CTSW-201ENST00000307886 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CTSW-201ENST00000307886 TEN1Q86WV5 123 aa7.99□□□□□ -1.13
CTSW-201ENST00000307886 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.99□□□□□ -1.13
CTSW-201ENST00000307886 ETDBQ3ZM63 59 aa7.98□□□□□ -1.13
CTSW-201ENST00000307886 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.98□□□□□ -1.13
CTSW-201ENST00000307886 DNAL4O96015 105 aa7.97□□□□□ -1.13
CTSW-201ENST00000307886 Q75L30 129 aa7.96□□□□□ -1.14
CTSW-201ENST00000307886 MTURNQ8N3F0 131 aa7.96□□□□□ -1.14
CTSW-201ENST00000307886 Q6Q795 121 aa7.94□□□□□ -1.14
CTSW-201ENST00000307886 H3BQ85 93 aa7.93□□□□□ -1.14
CTSW-201ENST00000307886 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.93□□□□□ -1.14
CTSW-201ENST00000307886 M0R2T5 61 aa7.92□□□□□ -1.14
CTSW-201ENST00000307886 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
CTSW-201ENST00000307886 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.91□□□□□ -1.14
CTSW-201ENST00000307886 GHRHP01286 108 aa7.9□□□□□ -1.14
CTSW-201ENST00000307886 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.9□□□□□ -1.14
CTSW-201ENST00000307886 Q96NJ1 140 aa7.9□□□□□ -1.14
CTSW-201ENST00000307886 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.89□□□□□ -1.15
CTSW-201ENST00000307886 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.88□□□□□ -1.15
CTSW-201ENST00000307886 A0A087WSZ3 146 aa7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.4 ms