RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
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PTPRN-201ENST00000295718 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.32□□□□□ -0.92
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PTPRN-201ENST00000295718 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.84□□□□□ -1
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PTPRN-201ENST00000295718 LCE6AA0A183 80 aa8.83□□□□□ -1
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PTPRN-201ENST00000295718 HRES1P13985 223 aa8.81□□□□□ -1
PTPRN-201ENST00000295718 A0A087X002 238 aa8.8□□□□□ -1
PTPRN-201ENST00000295718 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.8□□□□□ -1
PTPRN-201ENST00000295718 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.8□□□□□ -1
PTPRN-201ENST00000295718 Q75L30 129 aa8.78□□□□□ -1
PTPRN-201ENST00000295718 NUPR2A6NF83 97 aa8.77□□□□□ -1
PTPRN-201ENST00000295718 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
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