RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 CHTF8P0CG12 524 aa9.91□□□□□ -0.82
USP25-201ENST00000285679 LINC01556Q5JQF7 62 aa9.9□□□□□ -0.82
USP25-201ENST00000285679 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.9□□□□□ -0.82
USP25-201ENST00000285679 hDV103S1A0JD37 113 aa9.9□□□□□ -0.82
USP25-201ENST00000285679 DSCR10P59022 87 aa9.89□□□□□ -0.83
USP25-201ENST00000285679 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.89□□□□□ -0.83
USP25-201ENST00000285679 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa9.88□□□□□ -0.83
USP25-201ENST00000285679 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.87□□□□□ -0.83
USP25-201ENST00000285679 IGFL1Q6UW32 110 aa9.85□□□□□ -0.83
USP25-201ENST00000285679 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.84□□□□□ -0.83
USP25-201ENST00000285679 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.84□□□□□ -0.83
USP25-201ENST00000285679 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
USP25-201ENST00000285679 AKAP9Q99996 3911 aa9.81□□□□□ -0.84
USP25-201ENST00000285679 LINC00588Q9Y4M8 146 aa9.81□□□□□ -0.84
USP25-201ENST00000285679 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.8□□□□□ -0.84
USP25-201ENST00000285679 TENM2Q9NT68 2774 aa9.78□□□□□ -0.84
USP25-201ENST00000285679 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.77□□□□□ -0.85
USP25-201ENST00000285679 KRTAP10-11P60412 298 aa9.76□□□□□ -0.85
USP25-201ENST00000285679 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
USP25-201ENST00000285679 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
USP25-201ENST00000285679 H3BNG1 76 aa9.75□□□□□ -0.85
USP25-201ENST00000285679 A0A1B0GW54 56 aa9.75□□□□□ -0.85
USP25-201ENST00000285679 F8WDY8 70 aa9.73□□□□□ -0.85
USP25-201ENST00000285679 DNAH10OSP0CZ25 163 aa9.73□□□□□ -0.85
USP25-201ENST00000285679 SPRR4Q96PI1 79 aa9.72□□□□□ -0.85
USP25-201ENST00000285679 A8MU10 97 aa9.72□□□□□ -0.85
USP25-201ENST00000285679 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.72□□□□□ -0.85
USP25-201ENST00000285679 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.71□□□□□ -0.86
USP25-201ENST00000285679 Q1T7F1 81 aa9.71□□□□□ -0.86
USP25-201ENST00000285679 LIMD2Q9BT23 127 aa9.7□□□□□ -0.86
USP25-201ENST00000285679 COA5Q86WW8 74 aa9.68□□□□□ -0.86
USP25-201ENST00000285679 PRR15Q8IV56 129 aa9.68□□□□□ -0.86
USP25-201ENST00000285679 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
USP25-201ENST00000285679 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.65□□□□□ -0.86
USP25-201ENST00000285679 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.65□□□□□ -0.86
USP25-201ENST00000285679 TNP2Q05952 138 aa9.65□□□□□ -0.86
USP25-201ENST00000285679 A8MWP4 228 aa9.65□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 C16orf90A8MZG2 172 aa9.62□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 SPRR1AP35321 89 aa9.62□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.61□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 MOBPQ13875 183 aa9.61□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.61□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.6□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 SPINK1P00995 79 aa9.6□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa9.6□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 Q5VV11 94 aa9.6□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.59□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
USP25-201ENST00000285679 C14orf177Q52M58 125 aa9.58□□□□□ -0.88
USP25-201ENST00000285679 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.55□□□□□ -0.88
USP25-201ENST00000285679 CSMD3Q7Z407 3707 aa9.55□□□□□ -0.88
USP25-201ENST00000285679 COL7A1Q02388 2944 aa9.54□□□□□ -0.88
USP25-201ENST00000285679 H3BPC8 53 aa9.54□□□□□ -0.88
USP25-201ENST00000285679 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.52□□□□□ -0.88
USP25-201ENST00000285679 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.52□□□□□ -0.89
USP25-201ENST00000285679 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.49□□□□□ -0.89
USP25-201ENST00000285679 LCE6AA0A183 80 aa9.48□□□□□ -0.89
USP25-201ENST00000285679 CD164Q04900 197 aa9.48□□□□□ -0.89
USP25-201ENST00000285679 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa9.48□□□□□ -0.89
USP25-201ENST00000285679 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.47□□□□□ -0.89
USP25-201ENST00000285679 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa9.47□□□□□ -0.89
USP25-201ENST00000285679 IGKV2-30P06310 120 aa9.47□□□□□ -0.89
USP25-201ENST00000285679 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
USP25-201ENST00000285679 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.46□□□□□ -0.89
USP25-201ENST00000285679 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.46□□□□□ -0.9
USP25-201ENST00000285679 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.45□□□□□ -0.9
USP25-201ENST00000285679 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.45□□□□□ -0.9
USP25-201ENST00000285679 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.45□□□□□ -0.9
USP25-201ENST00000285679 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.44□□□□□ -0.9
USP25-201ENST00000285679 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
USP25-201ENST00000285679 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.42□□□□□ -0.9
USP25-201ENST00000285679 LCA10Q71F78 164 aa9.41□□□□□ -0.9
USP25-201ENST00000285679 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
USP25-201ENST00000285679 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.4□□□□□ -0.9
USP25-201ENST00000285679 K7EIL1 84 aa9.39□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 MDFIQ99750 246 aa9.39□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 PRAC1Q96KF2 57 aa9.39□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 SPINK7P58062 85 aa9.39□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 TGP01266 2768 aa9.38□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 A0A1B0GVX0 72 aa9.38□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.37□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 LY6G6CO95867 125 aa9.36□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 Q75L30 129 aa9.36□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.36□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 A0A1B0GU69 56 aa9.35□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 PANO1I0J062 215 aa9.34□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.34□□□□□ -0.91
USP25-201ENST00000285679 HRES1P13985 223 aa9.33□□□□□ -0.92
USP25-201ENST00000285679 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.32□□□□□ -0.92
USP25-201ENST00000285679 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
USP25-201ENST00000285679 ACYP2P14621 99 aa9.31□□□□□ -0.92
USP25-201ENST00000285679 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.31□□□□□ -0.92
USP25-201ENST00000285679 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.3□□□□□ -0.92
USP25-201ENST00000285679 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.3□□□□□ -0.92
USP25-201ENST00000285679 A0A087X002 238 aa9.29□□□□□ -0.92
USP25-201ENST00000285679 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms