RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.95□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.95□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 PKHD1P08F94 4074 aa6.94□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.94□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.94□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 RTL8CO15255 209 aa6.94□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.94□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP10-2P60368 255 aa6.93□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.92□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.92□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 PKD1P98161 4303 aa6.92□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 C3orf84H3BNL1 204 aa6.92□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 PRLHP81277 87 aa6.92□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 KLKP1Q107X0 134 aa6.92□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.92□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.92□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.91□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 UBE2BP63146 152 aa6.91□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.9□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.9□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.9□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 ERC2-IT1O76042 136 aa6.9□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.9□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 Q9BRP9 147 aa6.9□□□□□ -1.3
GGPS1-201ENST00000282841 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.9□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.88□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.88□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 PSPHP1O15172 72 aa6.88□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 REG3GQ6UW15 175 aa6.88□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 A8MU10 97 aa6.87□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.87□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.87□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 Q6ZRX8 168 aa6.86□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.86□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 PRYO14603 147 aa6.85□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 NDUFC1O43677 76 aa6.84□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 SPRR1AP35321 89 aa6.84□□□□□ -1.31
GGPS1-201ENST00000282841 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.83□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.83□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 A0A0G2JQZ4 141 aa6.83□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 RYR2Q92736 4967 aa6.82□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 Q8N377 158 aa6.82□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 Q6ZVQ6 151 aa6.81□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 KRTAP10-1P60331 282 aa6.81□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 UBE2AP49459 152 aa6.79□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.79□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.79□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 RYR3Q15413 4870 aa6.79□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 NDUFS5O43920 106 aa6.79□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 A8MUN3 132 aa6.78□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.78□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 LCE6AA0A183 80 aa6.78□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.78□□□□□ -1.32
GGPS1-201ENST00000282841 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.78□□□□□ -1.32
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GGPS1-201ENST00000282841 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.76□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.75□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 SCXQ7RTU7 201 aa6.75□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 Q1T7F1 81 aa6.75□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.75□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.75□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.75□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 Q6ZQT0 140 aa6.74□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.74□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 BCE1O60756 84 aa6.73□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.73□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 UBL5Q9BZL1 73 aa6.73□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 LCA10Q71F78 164 aa6.72□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 SMIM29Q86T20 159 aa6.71□□□□□ -1.33
GGPS1-201ENST00000282841 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.7□□□□□ -1.34
GGPS1-201ENST00000282841 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.7□□□□□ -1.34
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GGPS1-201ENST00000282841 hDV103S1A0JD37 113 aa6.7□□□□□ -1.34
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GGPS1-201ENST00000282841 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.67□□□□□ -1.34
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GGPS1-201ENST00000282841 HCG22E2RYF7 251 aa6.67□□□□□ -1.34
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1W2PNM2 257 aa6.66□□□□□ -1.34
GGPS1-201ENST00000282841 Q6ZSA8 131 aa6.66□□□□□ -1.34
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GGPS1-201ENST00000282841 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.64□□□□□ -1.35
GGPS1-201ENST00000282841 H0Y9J4 135 aa6.64□□□□□ -1.35
GGPS1-201ENST00000282841 Q5VV11 94 aa6.64□□□□□ -1.35
GGPS1-201ENST00000282841 IGFL1Q6UW32 110 aa6.64□□□□□ -1.35
GGPS1-201ENST00000282841 H3BQ85 93 aa6.63□□□□□ -1.35
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF861PO60384 105 aa6.63□□□□□ -1.35
GGPS1-201ENST00000282841 IGLV7-43P04211 117 aa6.63□□□□□ -1.35
GGPS1-201ENST00000282841 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1B0GVY2 172 aa6.62□□□□□ -1.35
GGPS1-201ENST00000282841 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.62□□□□□ -1.35
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