RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272602.6

CNGA3-201, Transcript of cyclic nucleotide gated channel alpha 3, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNGA3, Length 3,470 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3-201ENST00000272602 A0A096LNI7 61 aa7.02□□□□□ -1.29
CNGA3-201ENST00000272602 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
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CNGA3-201ENST00000272602 C15orf56Q8N910 161 aa6.99□□□□□ -1.29
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CNGA3-201ENST00000272602 H0Y9P7 68 aa6.97□□□□□ -1.29
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CNGA3-201ENST00000272602 Q9BRP9 147 aa6.97□□□□□ -1.29
CNGA3-201ENST00000272602 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.97□□□□□ -1.29
CNGA3-201ENST00000272602 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.96□□□□□ -1.3
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.96□□□□□ -1.3
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CNGA3-201ENST00000272602 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
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CNGA3-201ENST00000272602 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
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CNGA3-201ENST00000272602 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.9□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 IGFL1Q6UW32 110 aa6.9□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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CNGA3-201ENST00000272602 SPRR4Q96PI1 79 aa6.88□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 REG3GQ6UW15 175 aa6.88□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 LCE6AA0A183 80 aa6.87□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 CHTF8P0CG12 524 aa6.87□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.87□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 NUPR2A6NF83 97 aa6.87□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.87□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 ANK2Q01484 3957 aa6.86□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.86□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 COA5Q86WW8 74 aa6.86□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 TNP2Q05952 138 aa6.86□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.85□□□□□ -1.31
CNGA3-201ENST00000272602 LCA10Q71F78 164 aa6.82□□□□□ -1.32
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.82□□□□□ -1.32
CNGA3-201ENST00000272602 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.81□□□□□ -1.32
CNGA3-201ENST00000272602 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.81□□□□□ -1.32
CNGA3-201ENST00000272602 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.8□□□□□ -1.32
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CNGA3-201ENST00000272602 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.79□□□□□ -1.32
CNGA3-201ENST00000272602 APLNQ9ULZ1 77 aa6.79□□□□□ -1.32
CNGA3-201ENST00000272602 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.78□□□□□ -1.32
CNGA3-201ENST00000272602 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CNGA3-201ENST00000272602 SPRR1AP35321 89 aa6.78□□□□□ -1.32
CNGA3-201ENST00000272602 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.78□□□□□ -1.32
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CNGA3-201ENST00000272602 A8MWP4 228 aa6.76□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.76□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.75□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 CDK2AP2O75956 126 aa6.75□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 H3BPC8 53 aa6.75□□□□□ -1.33
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CNGA3-201ENST00000272602 Q75L30 129 aa6.74□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.74□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.74□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.74□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.73□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 SPINK7P58062 85 aa6.73□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.73□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.72□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 H3BNG1 76 aa6.72□□□□□ -1.33
CNGA3-201ENST00000272602 MOBPQ13875 183 aa6.71□□□□□ -1.34
CNGA3-201ENST00000272602 PRAC1Q96KF2 57 aa6.7□□□□□ -1.34
CNGA3-201ENST00000272602 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.7□□□□□ -1.34
CNGA3-201ENST00000272602 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.7□□□□□ -1.34
CNGA3-201ENST00000272602 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.7□□□□□ -1.34
CNGA3-201ENST00000272602 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.69□□□□□ -1.34
CNGA3-201ENST00000272602 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.69□□□□□ -1.34
CNGA3-201ENST00000272602 A6NN06 94 aa6.69□□□□□ -1.34
CNGA3-201ENST00000272602 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.67□□□□□ -1.34
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.67□□□□□ -1.34
CNGA3-201ENST00000272602 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
CNGA3-201ENST00000272602 RTL8CO15255 209 aa6.64□□□□□ -1.35
CNGA3-201ENST00000272602 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.64□□□□□ -1.35
CNGA3-201ENST00000272602 HRES1P13985 223 aa6.64□□□□□ -1.35
CNGA3-201ENST00000272602 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.64□□□□□ -1.35
CNGA3-201ENST00000272602 LYSTQ99698 3801 aa6.63□□□□□ -1.35
CNGA3-201ENST00000272602 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.63□□□□□ -1.35
CNGA3-201ENST00000272602 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.62□□□□□ -1.35
CNGA3-201ENST00000272602 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.62□□□□□ -1.35
CNGA3-201ENST00000272602 A0A087WTM6 91 aa6.61□□□□□ -1.35
CNGA3-201ENST00000272602 LINC00313P59037 77 aa6.61□□□□□ -1.35
CNGA3-201ENST00000272602 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.61□□□□□ -1.35
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