RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000631179.2

DNM1-215, Transcript of dynamin 1, human

TSL 3

Gene DNM1, Length 357 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNM1-215	ENST00000631179	DDT	P30046	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNM1-215	ENST00000631179	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNM1-215	ENST00000631179	YPEL4	Q96NS1	127 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DNM1-215	ENST00000631179	COMMD7	Q86VX2	200 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DNM1-215	ENST00000631179	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DNM1-215	ENST00000631179	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNM1-215	ENST00000631179	SPRR1B	P22528	89 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DNM1-215	ENST00000631179	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNM1-215	ENST00000631179	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DNM1-215	ENST00000631179	LEPROT	O15243	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DNM1-215	ENST00000631179	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	NMU	P48645	174 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179		J3QQQ9	107 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	PLN	P26678	52 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.88	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	HSBP1	O75506	76 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	SNAPIN	O95295	136 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	APOC3	P02656	99 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	LINC00310	P59036	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179		Q5XG85	94 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	CD164	Q04900	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	SVBP	Q8N300	66 aa		4.86	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179		A0A0J9YXY3	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	DPM2	O94777	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	LEPROTL1	O95214	131 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	HERVK_113	P61574	105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	LITAF	Q99732	161 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.84	□□□□□ -1.63
DNM1-215	ENST00000631179	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179		E9PLD3	99 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	SERF1A	O75920	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	IGKC	P01834	107 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.83	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	TIMM17B	O60830	172 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	NDUFA5	Q16718	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		4.82	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	TRGC2	P03986	189 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	VAMP3	Q15836	100 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	NPC2	P61916	151 aa		4.8	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	COX7B	P24311	80 aa		4.79	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179		H3BS24	57 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179		H7C2G1	150 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	FABP4	P15090	132 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	AKR1D1	P51857	326 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.78	□□□□□ -1.64
DNM1-215	ENST00000631179	SEC61G	P60059	68 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179	TAL2	Q16559	108 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179		Q1RN00	199 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179		M0R2T5	61 aa		4.76	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179	TRIAP1	O43715	76 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179		A0A1B0GWB2	263 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179	COLCA2	A8K830	154 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.73	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179	ZNF815P	A8K554	130 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		4.72	□□□□□ -1.65
DNM1-215	ENST00000631179	TCL1B	O95988	128 aa		4.71	□□□□□ -1.66
DNM1-215	ENST00000631179	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
DNM1-215	ENST00000631179	IFITM1	P13164	125 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNM1-215	ENST00000631179		Q6ZVH6	145 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNM1-215	ENST00000631179	USH2A	O75445	5202 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNM1-215	ENST00000631179	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.7	□□□□□ -1.66
DNM1-215	ENST00000631179		Q75L30	129 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNM1-215	ENST00000631179	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.69	□□□□□ -1.66
DNM1-215	ENST00000631179	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DNM1-215	ENST00000631179	HIST1H2BK	O60814	126 aa		4.68	□□□□□ -1.66
DNM1-215	ENST00000631179	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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