RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 MYO9AB2RTY4 2548 aa5.76□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF861PO60384 105 aa5.76□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 CRIPTQ9P021 101 aa5.74□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 IGFL1Q6UW32 110 aa5.73□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 COA5Q86WW8 74 aa5.73□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 H7BZZ5 65 aa5.72□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00528Q8N1L1 170 aa5.72□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 C15orf56Q8N910 161 aa5.72□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.72□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP10-3P60369 221 aa5.72□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 C19orf73Q9NVV2 129 aa5.72□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0G2JQZ4 141 aa5.71□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1W2PNN7 141 aa5.71□□□□□ -1.49
CYFIP1-208ENST00000617928 UQCR11O14957 56 aa5.71□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa5.71□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.71□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV7-43P04211 117 aa5.7□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 KLKP1Q107X0 134 aa5.7□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.7□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 DNAH12Q6ZR08 3092 aa5.7□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0D9SG42 100 aa5.7□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 M0R2T5 61 aa5.7□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1B0GVX0 72 aa5.69□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.68□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 ERC2-IT1O76042 136 aa5.68□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.68□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.68□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.66□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.66□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 Q6ZSA8 131 aa5.66□□□□□ -1.5
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8N1X5 172 aa5.65□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF575Q86XF7 245 aa5.64□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 CASC10Q5T4H9 136 aa5.64□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 LITAFQ99732 161 aa5.64□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.64□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 Q8N377 158 aa5.64□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 Q5XG85 94 aa5.63□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR34Q9NV39 138 aa5.63□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 PRAC1Q96KF2 57 aa5.61□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 SPRR4Q96PI1 79 aa5.61□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.6□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.6□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 TNP2Q05952 138 aa5.6□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 LUZP6Q538Z0 58 aa5.6□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 PCSK5Q92824 1860 aa5.6□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 F8P00451 2351 aa5.6□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.59□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.59□□□□□ -1.51
CYFIP1-208ENST00000617928 Q1T7F1 81 aa5.58□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A096LNT2 108 aa5.58□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM104AQ969W3 186 aa5.57□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 C5orf42Q9H799 3197 aa5.57□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 KLK9Q2XQG4 91 aa5.57□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.57□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.56□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 CEP350Q5VT06 3117 aa5.55□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0A0MQY5 61 aa5.54□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.54□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 MTORP42345 2549 aa5.53□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 CHD9Q3L8U1 2897 aa5.53□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 POLQO75417 2590 aa5.53□□□□□ -1.52
CYFIP1-208ENST00000617928 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa5.51□□□□□ -1.53
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.51□□□□□ -1.53
CYFIP1-208ENST00000617928 CSAG1Q6PB30 78 aa5.5□□□□□ -1.53
CYFIP1-208ENST00000617928 ZNF292O60281 2723 aa5.5□□□□□ -1.53
CYFIP1-208ENST00000617928 ACANP16112 2415 aa5.5□□□□□ -1.53
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1W2PNM2 257 aa5.49□□□□□ -1.53
CYFIP1-208ENST00000617928 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
CYFIP1-208ENST00000617928 LINC00483Q53H64 154 aa5.48□□□□□ -1.53
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP1-1Q07627 177 aa5.48□□□□□ -1.53
CYFIP1-208ENST00000617928 Q75L30 129 aa5.47□□□□□ -1.53
CYFIP1-208ENST00000617928 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.47□□□□□ -1.53
CYFIP1-208ENST00000617928 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.46□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A0C4DFX4 3053 aa5.45□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.45□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.44□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 S4R3F8 94 aa5.44□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 USP24Q9UPU5 2620 aa5.43□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 LAMA3Q16787 3333 aa5.42□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 OXTP01178 125 aa5.42□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 HRES1P13985 223 aa5.42□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 CHD7Q9P2D1 2997 aa5.41□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 HTTP42858 3142 aa5.41□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 A0A1B0GU33 70 aa5.41□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 Q5VSD8 79 aa5.41□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 BRCA2P51587 3418 aa5.41□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 Q5VV11 94 aa5.4□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 TRANK1O15050 2925 aa5.4□□□□□ -1.54
CYFIP1-208ENST00000617928 PLAC4Q8WY50 150 aa5.4□□□□□ -1.55
CYFIP1-208ENST00000617928 DMAC1Q96GE9 116 aa5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.5 ms