RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 Q6ZTC4 211 aa4.06□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa4.06□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 C3orf84H3BNL1 204 aa4.06□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 PRR4Q16378 134 aa4.06□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 DEFB135Q30KP9 77 aa4.06□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 Q8N9L7 120 aa4.06□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.06□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.05□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 OCR1Q9BZK8 76 aa4.05□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 A8MUN3 132 aa4.05□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 B9D2Q9BPU9 175 aa4.05□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 IGKV4-1P06312 121 aa4.04□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 ITPR1Q14643 2758 aa4.04□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 LELP1Q5T871 98 aa4.04□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 SMIM29Q86T20 159 aa4.04□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.04□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 A0A096LPF7 62 aa4.04□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 REG3AQ06141 175 aa4.04□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.04□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.04□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 HCG22E2RYF7 251 aa4.03□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 Q6ZRP5 223 aa4.03□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.03□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 LINC00208Q96KT6 92 aa4.03□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 LRBAP50851 2863 aa4.03□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 M0R378 163 aa4.03□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 SMR3AQ99954 134 aa4.03□□□□□ -1.76
SEH1L-210ENST00000592582 JMJD1CQ15652 2540 aa4.03□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 WNK1Q9H4A3 2382 aa4.02□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 M0R2N4 97 aa4.02□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 SYCNQ0VAF6 134 aa4.02□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 PSCAO43653 123 aa4.02□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 IGLV6-57P01721 117 aa4.02□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 ITPR3Q14573 2671 aa4.01□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 DEFB4AO15263 64 aa4.01□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 C10orf25Q5T742 122 aa4.01□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.01□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 CFAP46Q8IYW2 2715 aa4.01□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 CAMK2N2Q96S95 79 aa4□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 H3BPC8 53 aa4□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP10-3P60369 221 aa4□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa4□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 CYSRT1A8MQ03 144 aa4□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 XAGE1AQ9HD64 81 aa4□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 KLK12Q9UKR0 248 aa4□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 LCA10Q71F78 164 aa4□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 TLN2Q9Y4G6 2542 aa3.99□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 H3BNG1 76 aa3.99□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.99□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.99□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 CUBNO60494 3623 aa3.99□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.99□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 Q8NAQ8 132 aa3.99□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 CASC2Q6XLA1 102 aa3.98□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 C1orf137Q5JT78 98 aa3.98□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 TACC2O95359 2948 aa3.97□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 A0A0J9YWU9 116 aa3.97□□□□□ -1.77
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SEH1L-210ENST00000592582 KIAA0087Q14695 138 aa3.97□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.97□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.97□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 LINC00476Q8WZB0 136 aa3.97□□□□□ -1.77
SEH1L-210ENST00000592582 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.96□□□□□ -1.78
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SEH1L-210ENST00000592582 H0Y9P7 68 aa3.96□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 Q5VV11 94 aa3.96□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 COL12A1Q99715 3063 aa3.96□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
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SEH1L-210ENST00000592582 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.95□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 C16orf90A8MZG2 172 aa3.95□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 Q75L30 129 aa3.95□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 Q8NBF4 154 aa3.95□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 Q9BRP9 147 aa3.95□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 PRR34Q9NV39 138 aa3.95□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 NOTCH1P46531 2555 aa3.94□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 ATRQ13535 2644 aa3.94□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 CENPEQ02224 2701 aa3.94□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.94□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.94□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 FBN2P35556 2912 aa3.93□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 LCE6AA0A183 80 aa3.92□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 ACANP16112 2415 aa3.92□□□□□ -1.78
SEH1L-210ENST00000592582 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
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