RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584582.5

TOP3A-217, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 3,661 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-217ENST00000584582 A0A1W2PNN7 141 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-217ENST00000584582 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-217ENST00000584582 C22orf24Q9Y442 160 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-217ENST00000584582 C2orf48Q96LS8 159 aa7.45□□□□□ -1.22
TOP3A-217ENST00000584582 UBE2AP49459 152 aa7.44□□□□□ -1.22
TOP3A-217ENST00000584582 LINC00167Q96N53 147 aa7.44□□□□□ -1.22
TOP3A-217ENST00000584582 IGLV6-57P01721 117 aa7.44□□□□□ -1.22
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TOP3A-217ENST00000584582 H3BNG1 76 aa7.43□□□□□ -1.22
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TOP3A-217ENST00000584582 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.41□□□□□ -1.22
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TOP3A-217ENST00000584582 Q6JHZ5 121 aa7.41□□□□□ -1.22
TOP3A-217ENST00000584582 IMUPQ9GZP8 106 aa7.41□□□□□ -1.22
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TOP3A-217ENST00000584582 PDE6GP18545 87 aa7.37□□□□□ -1.23
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TOP3A-217ENST00000584582 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
TOP3A-217ENST00000584582 SERP2Q8N6R1 65 aa7.36□□□□□ -1.23
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TOP3A-217ENST00000584582 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-217ENST00000584582 J3KT08 172 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-217ENST00000584582 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-217ENST00000584582 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-217ENST00000584582 ERC2-IT1O76042 136 aa7.34□□□□□ -1.23
TOP3A-217ENST00000584582 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.33□□□□□ -1.24
TOP3A-217ENST00000584582 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.33□□□□□ -1.24
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TOP3A-217ENST00000584582 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.32□□□□□ -1.24
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TOP3A-217ENST00000584582 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.31□□□□□ -1.24
TOP3A-217ENST00000584582 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.31□□□□□ -1.24
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TOP3A-217ENST00000584582 H0Y9J4 135 aa7.3□□□□□ -1.24
TOP3A-217ENST00000584582 C14orf177Q52M58 125 aa7.3□□□□□ -1.24
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TOP3A-217ENST00000584582 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3A-217ENST00000584582 NDUFS5O43920 106 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3A-217ENST00000584582 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3A-217ENST00000584582 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.25□□□□□ -1.25
TOP3A-217ENST00000584582 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.25□□□□□ -1.25
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TOP3A-217ENST00000584582 C16orf90A8MZG2 172 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-217ENST00000584582 CDK2AP2O75956 126 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-217ENST00000584582 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-217ENST00000584582 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-217ENST00000584582 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-217ENST00000584582 APLNQ9ULZ1 77 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-217ENST00000584582 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-217ENST00000584582 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 F8WDY8 70 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 SMIM29Q86T20 159 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 A0A1W2PNM2 257 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 FAM236CP0DP71 79 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 TMEM258P61165 79 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 C5orf47Q569G3 176 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 Q8NBF4 154 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 COL7A1Q02388 2944 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 CRYGAP11844 174 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 CXCL6P80162 114 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 C4orf26Q17RF5 130 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 K7EQZ3 153 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-217ENST00000584582 IGFL1Q6UW32 110 aa7.15□□□□□ -1.27
TOP3A-217ENST00000584582 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.15□□□□□ -1.27
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TOP3A-217ENST00000584582 NDUFB1O75438 58 aa7.14□□□□□ -1.27
TOP3A-217ENST00000584582 PANO1I0J062 215 aa7.14□□□□□ -1.27
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