RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000581536.5

TOP3A-211, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 5

Gene TOP3A, Length 766 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-211ENST00000581536 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.7□□□□□ -1.5
TOP3A-211ENST00000581536 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.7□□□□□ -1.5
TOP3A-211ENST00000581536 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.7□□□□□ -1.5
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TOP3A-211ENST00000581536 NMUP48645 174 aa5.63□□□□□ -1.51
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TOP3A-211ENST00000581536 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.61□□□□□ -1.51
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TOP3A-211ENST00000581536 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
TOP3A-211ENST00000581536 LITAFQ99732 161 aa5.6□□□□□ -1.51
TOP3A-211ENST00000581536 MUC2Q02817 5179 aa5.59□□□□□ -1.51
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TOP3A-211ENST00000581536 IGLV6-57P01721 117 aa5.59□□□□□ -1.51
TOP3A-211ENST00000581536 Q9BRP9 147 aa5.59□□□□□ -1.51
TOP3A-211ENST00000581536 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.59□□□□□ -1.51
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TOP3A-211ENST00000581536 ATOH7Q8N100 152 aa5.58□□□□□ -1.52
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TOP3A-211ENST00000581536 ZNF815PA8K554 130 aa5.57□□□□□ -1.52
TOP3A-211ENST00000581536 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
TOP3A-211ENST00000581536 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.57□□□□□ -1.52
TOP3A-211ENST00000581536 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.57□□□□□ -1.52
TOP3A-211ENST00000581536 MUC17Q685J3 4493 aa5.55□□□□□ -1.52
TOP3A-211ENST00000581536 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.55□□□□□ -1.52
TOP3A-211ENST00000581536 Q6ZRX8 168 aa5.55□□□□□ -1.52
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TOP3A-211ENST00000581536 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.55□□□□□ -1.52
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TOP3A-211ENST00000581536 TIMM17BO60830 172 aa5.54□□□□□ -1.52
TOP3A-211ENST00000581536 LINC00483Q53H64 154 aa5.54□□□□□ -1.52
TOP3A-211ENST00000581536 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.54□□□□□ -1.52
TOP3A-211ENST00000581536 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.53□□□□□ -1.52
TOP3A-211ENST00000581536 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
TOP3A-211ENST00000581536 PCP2Q8IVA1 136 aa5.53□□□□□ -1.52
TOP3A-211ENST00000581536 C14orf144Q96I85 54 aa5.53□□□□□ -1.52
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TOP3A-211ENST00000581536 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.51□□□□□ -1.53
TOP3A-211ENST00000581536 C20orf202A1L168 122 aa5.5□□□□□ -1.53
TOP3A-211ENST00000581536 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.5□□□□□ -1.53
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TOP3A-211ENST00000581536 PRO1933Q9H354 126 aa5.5□□□□□ -1.53
TOP3A-211ENST00000581536 SCGB1D1O95968 90 aa5.49□□□□□ -1.53
TOP3A-211ENST00000581536 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.49□□□□□ -1.53
TOP3A-211ENST00000581536 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.48□□□□□ -1.53
TOP3A-211ENST00000581536 C6orf99Q4VX62 202 aa5.48□□□□□ -1.53
TOP3A-211ENST00000581536 M0R143 59 aa5.47□□□□□ -1.53
TOP3A-211ENST00000581536 SPINK1P00995 79 aa5.47□□□□□ -1.53
TOP3A-211ENST00000581536 A0A1B0GV90 55 aa5.46□□□□□ -1.54
TOP3A-211ENST00000581536 COX7BP24311 80 aa5.46□□□□□ -1.54
TOP3A-211ENST00000581536 TPRXLQ17RH7 258 aa5.46□□□□□ -1.54
TOP3A-211ENST00000581536 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.46□□□□□ -1.54
TOP3A-211ENST00000581536 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.46□□□□□ -1.54
TOP3A-211ENST00000581536 SVIPQ8NHG7 77 aa5.46□□□□□ -1.54
TOP3A-211ENST00000581536 A6NDN8 102 aa5.45□□□□□ -1.54
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