RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580838.1

PTPRM-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 676 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-212ENST00000580838 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 AKAP9Q99996 3911 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 JMJD1CQ15652 2540 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 USP24Q9UPU5 2620 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 VPREB1P12018 145 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 HTN3P15516 51 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRM-212ENST00000580838 NF1P21359 2839 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 EPM2AB3EWF7 344 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 H7BZZ5 65 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 J3QKU1 62 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP10-3P60369 221 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 NREPQ16612 68 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 Q8NDZ9 215 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 CELA1Q9UNI1 258 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.82□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 SONP18583 2426 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 BPY2O14599 106 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 PRYO14603 147 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 DEFB4AO15263 64 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 MRAPQ8TCY5 172 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 RMI2Q96E14 147 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 ZFHX3Q15911 3703 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 SYCNQ0VAF6 134 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 CCDC168Q8NDH2 2452 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 F8WEM9 126 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 Q6ZRU5 148 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 C15orf56Q8N910 161 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 HIVEP2P31629 2446 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.78□□□□□ -1.8
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PTPRM-212ENST00000580838 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRM-212ENST00000580838 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 OXTP01178 125 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 IGKV4-1P06312 121 aa3.77□□□□□ -1.81
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PTPRM-212ENST00000580838 Q5XG85 94 aa3.77□□□□□ -1.81
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PTPRM-212ENST00000580838 M0R2N4 97 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 Q6ZRX8 168 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 OCR1Q9BZK8 76 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 SNURFQ9Y675 71 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 A0A0U1RQV1 116 aa3.75□□□□□ -1.81
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PTPRM-212ENST00000580838 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 Q6ZRP5 223 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 SCXQ7RTU7 201 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 Q8NBF4 154 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 C7orf33Q8WU49 177 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 PRO0628Q9UI54 55 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa3.75□□□□□ -1.81
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PTPRM-212ENST00000580838 FN1P02751 2386 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 INAFM1C9JVW0 142 aa3.74□□□□□ -1.81
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PTPRM-212ENST00000580838 C1orf137Q5JT78 98 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 Q8N377 158 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 SPRR4Q96PI1 79 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 TENM4Q6N022 2769 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 LCE6AA0A183 80 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 NDUFB1O75438 58 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 C3orf84H3BNL1 204 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 SMR3AQ99954 134 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRM-212ENST00000580838 H3BPC8 53 aa3.71□□□□□ -1.82
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