RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578208.1

GGA3-204, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 478 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-204ENST00000578208 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.85□□□□□ -1.31
GGA3-204ENST00000578208 B5MCH6 92 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-204ENST00000578208 TSPAN13O95857 204 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-204ENST00000578208 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
GGA3-204ENST00000578208 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
GGA3-204ENST00000578208 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-204ENST00000578208 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-204ENST00000578208 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.84□□□□□ -1.31
GGA3-204ENST00000578208 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.83□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 PRR4Q16378 134 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 Q6ZRX8 168 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.82□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 Q6ZVH6 145 aa6.81□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 IFITM1P13164 125 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 PCP2Q8IVA1 136 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.8□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.79□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.78□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 Q9BRP9 147 aa6.78□□□□□ -1.32
GGA3-204ENST00000578208 ERC2-IT1O76042 136 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 SCGB1D1O95968 90 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 CTAG1AP78358 180 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 LINC00483Q53H64 154 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.77□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 A6NDN8 102 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.75□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 LRP2P98164 4655 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 C5orf52A6NGY3 159 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 COX7BP24311 80 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 C6orf99Q4VX62 202 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 Q8NBF4 154 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.74□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 MOBPQ13875 183 aa6.73□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.72□□□□□ -1.33
GGA3-204ENST00000578208 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.71□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 A0A1B0GWB2 263 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 SPINK1P00995 79 aa6.7□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 A4D1N5 150 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 HIST1H4GQ99525 98 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.68□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 COX8AP10176 69 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 TAL2Q16559 108 aa6.67□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 SPRR1BP22528 89 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 VAMP3Q15836 100 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 SPATA45Q537H7 98 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 VAMP8Q9BV40 100 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 LPAP08519 4548 aa6.66□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 DLEU1O43261 78 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 SLC25A20O43772 301 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.65□□□□□ -1.34
GGA3-204ENST00000578208 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.64□□□□□ -1.35
GGA3-204ENST00000578208 TPRXLQ17RH7 258 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-204ENST00000578208 C14orf144Q96I85 54 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-204ENST00000578208 CDIP1Q9H305 208 aa6.63□□□□□ -1.35
GGA3-204ENST00000578208 Q1RN00 199 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-204ENST00000578208 C12orf57Q99622 126 aa6.62□□□□□ -1.35
GGA3-204ENST00000578208 LIMD2Q9BT23 127 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-204ENST00000578208 HIGD1BQ9P298 99 aa6.61□□□□□ -1.35
GGA3-204ENST00000578208 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-204ENST00000578208 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-204ENST00000578208 Q8N377 158 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-204ENST00000578208 RAB37Q96AX2 223 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-204ENST00000578208 PRO1933Q9H354 126 aa6.59□□□□□ -1.35
GGA3-204ENST00000578208 hADV29S1A0JD25 119 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 LINC00575Q6W349 94 aa6.58□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 A6NJY4 79 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 F8WEM9 126 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 H7C2G1 150 aa6.57□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 CD164Q04900 197 aa6.56□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 A0A0B4J2C4 111 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 SNCGO76070 127 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 CFC1BP0CG36 223 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 CFC1P0CG37 223 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 Q6ZQY7 126 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 SMIM29Q86T20 159 aa6.55□□□□□ -1.36
GGA3-204ENST00000578208 PYY3Q5JQD4 70 aa6.54□□□□□ -1.36
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