RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560253.1

MEIS3-208, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEIS3, Length 1,060 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-208ENST00000560253 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.76□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.76□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.76□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.75□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 IGLV6-57P01721 117 aa8.75□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 S100A2P29034 98 aa8.75□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.75□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.75□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 SPANXCQ9NY87 97 aa8.75□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 B5MCH6 92 aa8.74□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.74□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.74□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 S100A6P06703 90 aa8.73□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.73□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 Q6ZRX8 168 aa8.72□□□□□ -1.01
MEIS3-208ENST00000560253 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.71□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.71□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.71□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.71□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 Q6ZVH6 145 aa8.7□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 LITAFQ99732 161 aa8.7□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.7□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.69□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 IFITM1P13164 125 aa8.69□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 ATOH7Q8N100 152 aa8.69□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.69□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 C5orf52A6NGY3 159 aa8.67□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 LINC00483Q53H64 154 aa8.67□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.66□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.66□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.66□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 Q9BRP9 147 aa8.65□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.65□□□□□ -1.02
MEIS3-208ENST00000560253 ERC2-IT1O76042 136 aa8.64□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.64□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 Q8NBF4 154 aa8.64□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.64□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.63□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 SPINK1P00995 79 aa8.63□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 A6NDN8 102 aa8.62□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 COX7BP24311 80 aa8.62□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.62□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 MOBPQ13875 183 aa8.61□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 PCP2Q8IVA1 136 aa8.61□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.61□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.6□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.59□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 C6orf99Q4VX62 202 aa8.59□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.59□□□□□ -1.03
MEIS3-208ENST00000560253 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.58□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 SCGB1D1O95968 90 aa8.58□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 A0A1B0GWB2 263 aa8.57□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 TAL2Q16559 108 aa8.57□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 CDIP1Q9H305 208 aa8.57□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.57□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 LPAP08519 4548 aa8.56□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 MUC2Q02817 5179 aa8.56□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 A4D1N5 150 aa8.56□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.56□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 TPRXLQ17RH7 258 aa8.55□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 VAMP3Q15836 100 aa8.54□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 SPRR1BP22528 89 aa8.53□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
MEIS3-208ENST00000560253 SLC25A20O43772 301 aa8.52□□□□□ -1.05
MEIS3-208ENST00000560253 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.52□□□□□ -1.05
MEIS3-208ENST00000560253 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.51□□□□□ -1.05
MEIS3-208ENST00000560253 A0A0U1RQV1 116 aa8.49□□□□□ -1.05
MEIS3-208ENST00000560253 HIST1H4GQ99525 98 aa8.49□□□□□ -1.05
MEIS3-208ENST00000560253 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.48□□□□□ -1.05
MEIS3-208ENST00000560253 LIMD2Q9BT23 127 aa8.48□□□□□ -1.05
MEIS3-208ENST00000560253 COX8AP10176 69 aa8.47□□□□□ -1.05
MEIS3-208ENST00000560253 PRO1933Q9H354 126 aa8.47□□□□□ -1.05
MEIS3-208ENST00000560253 Q8N377 158 aa8.46□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 DLEU1O43261 78 aa8.45□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 Q1RN00 199 aa8.45□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 SNCGO76070 127 aa8.42□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 CD164Q04900 197 aa8.42□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.42□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 VAMP8Q9BV40 100 aa8.42□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.41□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 F8WEM9 126 aa8.41□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 H7C2G1 150 aa8.41□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 SPATA45Q537H7 98 aa8.41□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.41□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 hADV29S1A0JD25 119 aa8.4□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 C14orf144Q96I85 54 aa8.4□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.4□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.4□□□□□ -1.06
MEIS3-208ENST00000560253 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.39□□□□□ -1.07
MEIS3-208ENST00000560253 LINC00575Q6W349 94 aa8.39□□□□□ -1.07
MEIS3-208ENST00000560253 RAB37Q96AX2 223 aa8.39□□□□□ -1.07
MEIS3-208ENST00000560253 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80.6 ms