RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	PRO0628	Q9UI54	55 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		6.62	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A1B0GUV1	79 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573		F8WDY8	70 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	6.61	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		6.61	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	SLPI	P03973	132 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	6.6	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	EPM2A	B3EWF7	344 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	DNAL4	O96015	105 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		6.6	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		6.59	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		6.59	□□□□□ -1.35
FAM227B-208	ENST00000559573	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		6.58	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	PFN2	P35080	140 aa		6.58	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		6.58	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	PANO1	I0J062	215 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	6.57	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	C15orf56	Q8N910	161 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	LINC00846	Q9NV44	126 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		6.57	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	COX6A2	Q02221	97 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A087WVE0	104 aa		6.56	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	CHTF8	P0CG12	524 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	RMI2	Q96E14	147 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	MYCBP2	O75592	4640 aa		6.55	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM236C	P0DP71	79 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		6.54	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	BCE1	O60756	84 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573	GHRH	P01286	108 aa		6.53	□□□□□ -1.36
FAM227B-208	ENST00000559573		H0YGX0	51 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	6.52	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	SS18	Q15532	418 aa		6.52	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		6.51	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		6.51	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	CCK	P06307	115 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A0U1RRA0	63 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		6.5	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	SCX	Q7RTU7	201 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	C20orf197	Q8N268	126 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A087WYN8	130 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573		H7BZZ5	65 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	C10orf25	Q5T742	122 aa		6.49	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		6.48	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		6.47	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573		Q6ZRU5	148 aa		6.47	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		6.47	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	NCR3	O14931	201 aa		6.46	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	CDK2AP2	O75956	126 aa		6.46	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	6.46	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		6.46	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		6.46	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		6.46	□□□□□ -1.37
FAM227B-208	ENST00000559573	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	6.46	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		6.46	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	IGKV2D-28	P01615	120 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	KLKP1	Q107X0	134 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A096LNI7	61 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	SEC61G	P60059	68 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	SPAG11B	Q08648	103 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		6.45	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573		Q6ZSA8	131 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573		V9GYY9	64 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	C14orf177	Q52M58	125 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573		Q5VSD8	79 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		6.44	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	6.43	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	6.43	□□□□□ -1.38
FAM227B-208	ENST00000559573	LINC00167	Q96N53	147 aa		6.43	□□□□□ -1.38

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