RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.59□□□□□ -1.99
TMOD3-204ENST00000558666 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 LINC01549A6NIU2 74 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 OXTP01178 125 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 IGKCP01834 107 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 UBE2AP49459 152 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 REG3GQ6UW15 175 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 ANAPC11Q9NYG5 84 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFA12Q9UI09 145 aa2.58□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 H0Y9J4 135 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 DPM2O94777 84 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 HERVK_113P61574 105 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 SPINK6Q6UWN8 80 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 BOD1L2Q8IYS8 172 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 Q8NBF4 154 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 DIRC1Q969H9 104 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 HSPB8Q9UJY1 196 aa2.57□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa2.56□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.56□□□□□ -2
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TMOD3-204ENST00000558666 BCE1O60756 84 aa2.56□□□□□ -2
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TMOD3-204ENST00000558666 PLNP26678 52 aa2.56□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 PLEKHB2Q96CS7 222 aa2.56□□□□□ -2
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TMOD3-204ENST00000558666 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa2.55□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF815PA8K554 130 aa2.55□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.55□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 NMUP48645 174 aa2.55□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 LINC01600Q96MT4 127 aa2.55□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.55□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.55□□□□□ -2
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TMOD3-204ENST00000558666 A0A0J9YXY3 114 aa2.54□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa2.54□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 M0R378 163 aa2.54□□□□□ -2
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TMOD3-204ENST00000558666 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.54□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.54□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 TNXBP22105 4242 aa2.53□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa2.53□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa2.53□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa2.53□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 E9PLD3 99 aa2.53□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF861PO60384 105 aa2.53□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 S100A2P29034 98 aa2.53□□□□□ -2
TMOD3-204ENST00000558666 COX17Q14061 63 aa2.53□□□□□ -2
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TMOD3-204ENST00000558666 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.53□□□□□ -2
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TMOD3-204ENST00000558666 C20orf202A1L168 122 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 S100A6P06703 90 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 DDTP30046 118 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 PRR4Q16378 134 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 SFTA2Q6UW10 78 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 SCGB1D4Q6XE38 83 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 PCP2Q8IVA1 136 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 Q8N377 158 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 C12orf57Q99622 126 aa2.52□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.51□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 S100A1P23297 94 aa2.51□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP10-8P60410 259 aa2.51□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.51□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 HIST1H2BLQ99880 126 aa2.51□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.51□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 ERC2-IT1O76042 136 aa2.5□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 CRYGAP11844 174 aa2.5□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 MOBPQ13875 183 aa2.5□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.5□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00308Q8TCZ7 52 aa2.5□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.5□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 SPRR4Q96PI1 79 aa2.5□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.5□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 S100A12P80511 92 aa2.49□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.49□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00337Q8N6G1 96 aa2.49□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.49□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.49□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 Q9BRP9 147 aa2.49□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 LPAP08519 4548 aa2.49□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 A6NDN8 102 aa2.48□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.48□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 HSBP1L1C9JCN9 74 aa2.48□□□□□ -2.01
TMOD3-204ENST00000558666 H7C2G1 150 aa2.48□□□□□ -2.01
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