RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557549.5

RBM23-231, Transcript of RNA binding motif protein 23, human

TSL 3

Gene RBM23, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM23-231	ENST00000557549	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM23-231	ENST00000557549	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM23-231	ENST00000557549	SPANXC	Q9NY87	97 aa		7.4	□□□□□ -1.22
RBM23-231	ENST00000557549	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	IFITM1	P13164	125 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	DDT	P30046	118 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	7.39	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		7.39	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	IGLV6-57	P01721	117 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	XP32	Q5T750	250 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		7.38	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	SCGB1D1	O95968	90 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	PRLH	P81277	87 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	PCP2	Q8IVA1	136 aa		7.37	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	NPC2	P61916	151 aa		7.36	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		7.35	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	LRP2	P98164	4655 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	CRYGA	P11844	174 aa		7.34	□□□□□ -1.23
RBM23-231	ENST00000557549	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		7.33	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549		B5MCH6	92 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		7.32	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549	DLEU1	O43261	78 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549		Q6ZRX8	168 aa		7.31	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549	COX8A	P10176	69 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549	SPRR4	Q96PI1	79 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549		A0A087X002	238 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM23-231	ENST00000557549	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	CTAG1A	P78358	180 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	VAMP8	Q9BV40	100 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	SPATA45	Q537H7	98 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	LINC00483	Q53H64	154 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549		Q9BRP9	147 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	HIGD1B	Q9P298	99 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	LPA	P08519	4548 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549		A6NDN8	102 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	C6orf99	Q4VX62	202 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	HIST1H4G	Q99525	98 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	RNF213	Q63HN8	5207 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549		A0A1B0GWB2	263 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549		A4D1N5	150 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	ERC2-IT1	O76042	136 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	COX7B	P24311	80 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	C14orf144	Q96I85	54 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM23-231	ENST00000557549	PYY3	Q5JQD4	70 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	TSPAN13	O95857	204 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	TAL2	Q16559	108 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	SPRR1B	P22528	89 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	VAMP3	Q15836	100 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	7.17	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	PRR4	Q16378	134 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		7.16	□□□□□ -1.26
RBM23-231	ENST00000557549		A0A0B4J2C4	111 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	CEND1	Q8N111	149 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		7.14	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	SLC25A20	O43772	301 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	CFC1B	P0CG36	223 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	CFC1	P0CG37	223 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		7.13	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	SPINK1	P00995	79 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	MOBP	Q13875	183 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549		Q8NBF4	154 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	RAB37	Q96AX2	223 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		7.12	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	C12orf57	Q99622	126 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		7.11	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	HSD52	Q0P140	79 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	LINC00575	Q6W349	94 aa		7.1	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		7.09	□□□□□ -1.27
RBM23-231	ENST00000557549	hADV29S1	A0JD25	119 aa		7.08	□□□□□ -1.28

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms