RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553024.1

PPP1CC-210, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, human

TSL 2

Gene PPP1CC, Length 2,797 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CC-210	ENST00000553024	MIF	P14174	115 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	C3orf84	H3BNL1	204 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024		Q8NAQ8	132 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	MRAP	Q8TCY5	172 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024		A0A0U1RQV1	116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024		A0A1B0GUV1	79 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024		F8WDY8	70 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	RETN	Q9HD89	108 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.67	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024		A0A1W2PNN7	141 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	NDUFC2	O95298	119 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	TENM2	Q9NT68	2774 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PPP1CC-210	ENST00000553024	B9D2	Q9BPU9	175 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.65	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.64	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024		A0A0J9YWU9	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	PRR4	Q16378	134 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	COX17	Q14061	63 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	NREP	Q16612	68 aa		4.63	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	COX7B	P24311	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024		Q6ZRU5	148 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.62	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	VPREB1	P12018	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024		Q6ZRP5	223 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024		Q6ZTC4	211 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.59	□□□□□ -1.67
PPP1CC-210	ENST00000553024	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.59	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	CXCL6	P80162	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	TG	P01266	2768 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	SEC61G	P60059	68 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024		Q8N377	158 aa		4.57	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	LELP1	Q5T871	98 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024		H3BNG1	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	CASC10	Q5T4H9	136 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024		A8MU10	97 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	PRY	O14603	147 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024		A0A1W2PNM2	257 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.54	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024		M0R378	163 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	ESRG	Q1W209	222 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	PSPHP1	O15172	72 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024		Q9BRP9	147 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024		K7EQZ3	153 aa		4.53	□□□□□ -1.68
PPP1CC-210	ENST00000553024	PDE6G	P18545	87 aa		4.52	□□□□□ -1.69
PPP1CC-210	ENST00000553024	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
PPP1CC-210	ENST00000553024	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
PPP1CC-210	ENST00000553024	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.51	□□□□□ -1.69

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms