RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.35□□□□□ -1.87
CLSTN3-215ENST00000544584 IFITM1P13164 125 aa3.35□□□□□ -1.87
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00310P59036 64 aa3.35□□□□□ -1.87
CLSTN3-215ENST00000544584 PRLHP81277 87 aa3.35□□□□□ -1.87
CLSTN3-215ENST00000544584 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.35□□□□□ -1.87
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.34□□□□□ -1.87
CLSTN3-215ENST00000544584 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.34□□□□□ -1.87
CLSTN3-215ENST00000544584 C3orf79P0CE67 100 aa3.34□□□□□ -1.87
CLSTN3-215ENST00000544584 PRR4Q16378 134 aa3.34□□□□□ -1.87
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.34□□□□□ -1.87
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.34□□□□□ -1.87
CLSTN3-215ENST00000544584 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.34□□□□□ -1.87
CLSTN3-215ENST00000544584 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.34□□□□□ -1.87
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 SNCGO76070 127 aa3.33□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLV6-57P01721 117 aa3.33□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.33□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 LCE2CQ5TA81 110 aa3.33□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 DAND5Q8N907 189 aa3.33□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.32□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.32□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.32□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 A4D1N5 150 aa3.32□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 TSPAN13O95857 204 aa3.32□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 SPRR1AP35321 89 aa3.32□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 VAMP3Q15836 100 aa3.32□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 Q6ZRX8 168 aa3.32□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.32□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.32□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 SPRR4Q96PI1 79 aa3.32□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3.32□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A087X002 238 aa3.31□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.31□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 B5MCH6 92 aa3.31□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC25A20O43772 301 aa3.31□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 SPINK1P00995 79 aa3.31□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 NPC2P61916 151 aa3.31□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.31□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 LPAP08519 4548 aa3.3□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 A6NDN8 102 aa3.3□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 GAGE2AQ6NT46 116 aa3.3□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.3□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.3□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1B0GWB2 263 aa3.29□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 SCGB1D1O95968 90 aa3.29□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 SMIM6P0DI80 62 aa3.29□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 COX7BP24311 80 aa3.29□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00483Q53H64 154 aa3.29□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.29□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.29□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 Q8NDZ9 215 aa3.29□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.28□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 GHRHP01286 108 aa3.28□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 TAL2Q16559 108 aa3.28□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.28□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.28□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.28□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 LIMD2Q9BT23 127 aa3.28□□□□□ -1.88
CLSTN3-215ENST00000544584 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 ATOH7Q8N100 152 aa3.27□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 Q8NBF4 154 aa3.27□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 HIST1H4GQ99525 98 aa3.27□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 LITAFQ99732 161 aa3.27□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 CDIP1Q9H305 208 aa3.27□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.26□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.26□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.26□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 F8WEM9 126 aa3.26□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 MOBPQ13875 183 aa3.26□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 C6orf99Q4VX62 202 aa3.26□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.26□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.26□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.26□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.26□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 Q9BRP9 147 aa3.26□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa3.25□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 A6NJY4 79 aa3.25□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 TPRXLQ17RH7 258 aa3.25□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 ANKRD39Q53RE8 183 aa3.25□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 PCP2Q8IVA1 136 aa3.25□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.25□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 DLEU1O43261 78 aa3.24□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 SPRR1BP22528 89 aa3.24□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 C12orf57Q99622 126 aa3.24□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 VAMP8Q9BV40 100 aa3.24□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 PRO1933Q9H354 126 aa3.24□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 hADV29S1A0JD25 119 aa3.23□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 H7C2G1 150 aa3.23□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 ERC2-IT1O76042 136 aa3.23□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 TCL1BO95988 128 aa3.23□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 COX8AP10176 69 aa3.23□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 CD164Q04900 197 aa3.23□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.23□□□□□ -1.89
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.23□□□□□ -1.89
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