RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537075.2

KCNS1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-202ENST00000537075 NKAPP1Q8N9T2 125 aa14.66□□□□□ -0.06
KCNS1-202ENST00000537075 UBL5Q9BZL1 73 aa14.66□□□□□ -0.06
KCNS1-202ENST00000537075 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa14.66□□□□□ -0.06
KCNS1-202ENST00000537075 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa14.66□□□□□ -0.06
KCNS1-202ENST00000537075 ATOX1O00244 68 aa14.65□□□□□ -0.06
KCNS1-202ENST00000537075 PDE6GP18545 87 aa14.65□□□□□ -0.06
KCNS1-202ENST00000537075 C3orf22Q8N5N4 141 aa14.64□□□□□ -0.07
KCNS1-202ENST00000537075 GHRHP01286 108 aa14.63□□□□□ -0.07
KCNS1-202ENST00000537075 RMI2Q96E14 147 aa14.63□□□□□ -0.07
KCNS1-202ENST00000537075 FAM168BA1KXE4 195 aa14.62□□□□□ -0.07
KCNS1-202ENST00000537075 UQCRQO14949 82 aa14.62□□□□□ -0.07
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa14.61□□□□□ -0.07
KCNS1-202ENST00000537075 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa14.6□□□□□ -0.07
KCNS1-202ENST00000537075 LYSTQ99698 3801 aa14.6□□□□□ -0.07
KCNS1-202ENST00000537075 COX7CP15954 63 aa14.6□□□□□ -0.07
KCNS1-202ENST00000537075 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa14.59□□□□□ -0.07
KCNS1-202ENST00000537075 DNAH10Q8IVF4 4471 aa14.58□□□□□ -0.08
KCNS1-202ENST00000537075 Q6ZVQ6 151 aa14.58□□□□□ -0.08
KCNS1-202ENST00000537075 STAB2Q8WWQ8 2551 aa14.57□□□□□ -0.08
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
KCNS1-202ENST00000537075 C9orf153Q5TBE3 101 aa14.56□□□□□ -0.08
KCNS1-202ENST00000537075 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa14.55□□□□□ -0.08
KCNS1-202ENST00000537075 RPL37AP8A6NKH3 93 aa14.55□□□□□ -0.08
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.55□□□□□ -0.08
KCNS1-202ENST00000537075 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
KCNS1-202ENST00000537075 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
KCNS1-202ENST00000537075 PRYO14603 147 aa14.53□□□□□ -0.08
KCNS1-202ENST00000537075 SPRR1AP35321 89 aa14.53□□□□□ -0.08
KCNS1-202ENST00000537075 Q6ZRX8 168 aa14.52□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa14.51□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 Q8N377 158 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 Q9BRP9 147 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 SERP2Q8N6R1 65 aa14.5□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 HAMPP81172 84 aa14.48□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 CRYGAP11844 174 aa14.48□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 SMIM20Q8N5G0 67 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa14.47□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 DEFB105AQ8NG35 78 aa14.46□□□□□ -0.09
KCNS1-202ENST00000537075 CXCL6P80162 114 aa14.45□□□□□ -0.1
KCNS1-202ENST00000537075 APLNQ9ULZ1 77 aa14.45□□□□□ -0.1
KCNS1-202ENST00000537075 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa14.44□□□□□ -0.1
KCNS1-202ENST00000537075 NUPR2A6NF83 97 aa14.43□□□□□ -0.1
KCNS1-202ENST00000537075 CYSTM1Q9H1C7 97 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNS1-202ENST00000537075 CSMD3Q7Z407 3707 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNS1-202ENST00000537075 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa14.42□□□□□ -0.1
KCNS1-202ENST00000537075 DNAH7Q8WXX0 4024 aa14.4□□□□□ -0.1
KCNS1-202ENST00000537075 CNBPP62633 177 aaKnown RBP14.39□□□□□ -0.11
KCNS1-202ENST00000537075 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNS1-202ENST00000537075 A0A096LNI7 61 aa14.39□□□□□ -0.11
KCNS1-202ENST00000537075 SCXQ7RTU7 201 aa14.38□□□□□ -0.11
KCNS1-202ENST00000537075 ERC2-IT1O76042 136 aa14.38□□□□□ -0.11
KCNS1-202ENST00000537075 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa14.37□□□□□ -0.11
KCNS1-202ENST00000537075 TNP2Q05952 138 aa14.36□□□□□ -0.11
KCNS1-202ENST00000537075 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
KCNS1-202ENST00000537075 C16orf90A8MZG2 172 aa14.35□□□□□ -0.11
KCNS1-202ENST00000537075 REG3GQ6UW15 175 aa14.35□□□□□ -0.11
KCNS1-202ENST00000537075 PSCAO43653 123 aa14.34□□□□□ -0.11
KCNS1-202ENST00000537075 TENM2Q9NT68 2774 aa14.33□□□□□ -0.12
KCNS1-202ENST00000537075 A0A1W2PNN7 141 aa14.32□□□□□ -0.12
KCNS1-202ENST00000537075 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa14.32□□□□□ -0.12
KCNS1-202ENST00000537075 UBE2BP63146 152 aa14.31□□□□□ -0.12
KCNS1-202ENST00000537075 C3orf84H3BNL1 204 aa14.3□□□□□ -0.12
KCNS1-202ENST00000537075 BCE1O60756 84 aa14.3□□□□□ -0.12
KCNS1-202ENST00000537075 A0A1W2PNM2 257 aa14.29□□□□□ -0.12
KCNS1-202ENST00000537075 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
KCNS1-202ENST00000537075 NREPQ16612 68 aa14.27□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 C1orf137Q5JT78 98 aa14.26□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 FBN3Q75N90 2809 aa14.25□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 SMIM29Q86T20 159 aa14.24□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 TRAV7A0A075B6U4 112 aa14.24□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 C14orf177Q52M58 125 aa14.24□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 Q8N9L7 120 aa14.23□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 IGKV4-1P06312 121 aa14.23□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.23□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 A0A1B0GW54 56 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 Q8NBF4 154 aa14.22□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 CHTF8P0CG12 524 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 PRLHP81277 87 aa14.21□□□□□ -0.13
KCNS1-202ENST00000537075 STARD9Q9P2P6 4700 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNS1-202ENST00000537075 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNS1-202ENST00000537075 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNS1-202ENST00000537075 SPRR4Q96PI1 79 aa14.2□□□□□ -0.14
KCNS1-202ENST00000537075 TMEM258P61165 79 aa14.18□□□□□ -0.14
KCNS1-202ENST00000537075 C5orf47Q569G3 176 aa14.18□□□□□ -0.14
KCNS1-202ENST00000537075 C20orf197Q8N268 126 aa14.18□□□□□ -0.14
KCNS1-202ENST00000537075 VPS13DQ5THJ4 4388 aa14.18□□□□□ -0.14
KCNS1-202ENST00000537075 BPY2O14599 106 aa14.18□□□□□ -0.14
KCNS1-202ENST00000537075 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
KCNS1-202ENST00000537075 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
KCNS1-202ENST00000537075 C9orf163Q8N9P6 203 aa14.17□□□□□ -0.14
KCNS1-202ENST00000537075 LINC00476Q8WZB0 136 aa14.14□□□□□ -0.15
KCNS1-202ENST00000537075 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa14.14□□□□□ -0.15
KCNS1-202ENST00000537075 HIGD2AQ9BW72 106 aa14.12□□□□□ -0.15
KCNS1-202ENST00000537075 A0A0G2JQZ4 141 aa14.09□□□□□ -0.15
KCNS1-202ENST00000537075 IGFL1Q6UW32 110 aa14.09□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms