RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531385.1

PTPRU-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-211ENST00000531385 S100A12P80511 92 aa10.93□□□□□ -0.66
PTPRU-211ENST00000531385 PRR4Q16378 134 aa10.93□□□□□ -0.66
PTPRU-211ENST00000531385 HIST1H2BLQ99880 126 aa10.93□□□□□ -0.66
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PTPRU-211ENST00000531385 PCP2Q8IVA1 136 aa10.91□□□□□ -0.66
PTPRU-211ENST00000531385 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.91□□□□□ -0.66
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PTPRU-211ENST00000531385 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.81□□□□□ -0.68
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PTPRU-211ENST00000531385 TPRXLQ17RH7 258 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRU-211ENST00000531385 C14orf144Q96I85 54 aa10.6□□□□□ -0.71
PTPRU-211ENST00000531385 HIST1H4GQ99525 98 aa10.59□□□□□ -0.71
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PTPRU-211ENST00000531385 SPATA45Q537H7 98 aa10.58□□□□□ -0.72
PTPRU-211ENST00000531385 Q8N377 158 aa10.58□□□□□ -0.72
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PTPRU-211ENST00000531385 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
PTPRU-211ENST00000531385 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa10.55□□□□□ -0.72
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PTPRU-211ENST00000531385 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.53□□□□□ -0.72
PTPRU-211ENST00000531385 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
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PTPRU-211ENST00000531385 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRU-211ENST00000531385 C2orf91Q6ZV80 131 aa10.51□□□□□ -0.73
PTPRU-211ENST00000531385 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
PTPRU-211ENST00000531385 H7C2G1 150 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRU-211ENST00000531385 VAMP3Q15836 100 aa10.49□□□□□ -0.73
PTPRU-211ENST00000531385 LINC00575Q6W349 94 aa10.49□□□□□ -0.73
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PTPRU-211ENST00000531385 PYY3Q5JQD4 70 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRU-211ENST00000531385 Q6ZQY7 126 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRU-211ENST00000531385 PRO1933Q9H354 126 aa10.46□□□□□ -0.73
PTPRU-211ENST00000531385 hADV29S1A0JD25 119 aa10.44□□□□□ -0.74
PTPRU-211ENST00000531385 LIMD2Q9BT23 127 aa10.43□□□□□ -0.74
PTPRU-211ENST00000531385 RAB37Q96AX2 223 aa10.42□□□□□ -0.74
PTPRU-211ENST00000531385 CEND1Q8N111 149 aa10.4□□□□□ -0.74
PTPRU-211ENST00000531385 A0A0B4J2C4 111 aa10.39□□□□□ -0.75
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