RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.91□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 A0A1B0GW54 56 aa4.91□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 SPRR1AP35321 89 aa4.91□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.91□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 Q9HAA7 133 aa4.91□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.91□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
PACS1-211ENST00000531298 CCKP06307 115 aa4.9□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.9□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 C16orf90A8MZG2 172 aa4.89□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 SLPIP03973 132 aa4.89□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 GAGE2BQ13066 116 aa4.89□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 GAGE2EQ4V326 116 aa4.89□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.89□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.89□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.89□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.89□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 MT-ATP8P03928 68 aa4.88□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.88□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.87□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.87□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 C7orf33Q8WU49 177 aa4.87□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.87□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 A0A1B0GV72 72 aa4.86□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 Q6JHZ5 121 aa4.86□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZQY7 126 aa4.86□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.86□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.85□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 EPM2AB3EWF7 344 aa4.85□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 H0Y9J4 135 aa4.85□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 PSCAO43653 123 aa4.85□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.85□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZQT0 140 aa4.85□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZRX8 168 aa4.85□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.85□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 DSCR8Q96T75 97 aa4.85□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.85□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.85□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.84□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.84□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.84□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.84□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.84□□□□□ -1.63
PACS1-211ENST00000531298 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.83□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 B5MCH6 92 aa4.83□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 CASC10Q5T4H9 136 aa4.83□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 BCE1O60756 84 aa4.82□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 UBL5Q9BZL1 73 aa4.82□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 LINC00846Q9NV44 126 aa4.82□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.82□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.81□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 REG3GQ6UW15 175 aa4.81□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZR54 194 aa4.81□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.81□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.81□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.81□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 CXCL6P80162 114 aa4.8□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.78□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 A0A096LNI7 61 aa4.78□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 SPRR1BP22528 89 aa4.78□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 Q8N377 158 aa4.78□□□□□ -1.64
PACS1-211ENST00000531298 ATOX1O00244 68 aa4.77□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 Q9BRP9 147 aa4.77□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.77□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 A0A087WTM6 91 aa4.76□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 FAM168BA1KXE4 195 aa4.76□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 A0A1W2PNN7 141 aa4.75□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 H3BS24 57 aa4.75□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.75□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 SPRR4Q96PI1 79 aa4.75□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.74□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 Q6ZVQ6 151 aa4.74□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.74□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.74□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa4.74□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.73□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.73□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 C3orf84H3BNL1 204 aa4.73□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 UQCRQO14949 82 aa4.73□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 UBE2BP63146 152 aa4.73□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 Q8NBF4 154 aa4.73□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 COL7A1Q02388 2944 aa4.73□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 F8WEM9 126 aa4.72□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 CRYGAP11844 174 aa4.72□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 C1orf134Q5TEV5 83 aa4.72□□□□□ -1.65
PACS1-211ENST00000531298 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.72□□□□□ -1.65
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