RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	MUC17	Q685J3	4493 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014		B5MCH6	92 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFC2	O95298	119 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV6-57	P01721	117 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMIM6	P0DI80	62 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	DDT	P30046	118 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	S100A12	P80511	92 aa		7.33	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	7.33	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERC2-IT1	O76042	136 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	NPC2	P61916	151 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q9BRP9	147 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		7.32	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	MUC2	Q02817	5179 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPATA45	Q537H7	98 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00483	Q53H64	154 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		7.31	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	CTAG1A	P78358	180 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		7.29	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	TIMM17B	O60830	172 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q6ZRX8	168 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	C12orf57	Q99622	126 aa		7.28	□□□□□ -1.24
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF815P	A8K554	130 aa		7.27	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCP2	Q8IVA1	136 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	C14orf144	Q96I85	54 aa		7.26	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	COX8A	P10176	69 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q8NBF4	154 aa		7.25	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPANXC	Q9NY87	97 aa		7.24	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	DLEU1	O43261	78 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	TPRXL	Q17RH7	258 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRO1933	Q9H354	126 aa		7.22	□□□□□ -1.25
SH3BP2-222	ENST00000512014	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		7.21	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	MOBP	Q13875	183 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		7.2	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	TSTD3	H0UI37	97 aa		7.19	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPINK1	P00995	79 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		7.18	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		7.17	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	SPRR1B	P22528	89 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	7.16	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	7.16	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q8N377	158 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIGD1B	Q9P298	99 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		7.16	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	C6orf99	Q4VX62	202 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q6ZVH6	145 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	HIST1H4G	Q99525	98 aa		7.15	□□□□□ -1.26
SH3BP2-222	ENST00000512014	IFITM1	P13164	125 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	COPS9	Q8WXC6	57 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	CDIP1	Q9H305	208 aa		7.14	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	COX7B	P24311	80 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	7.13	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		7.13	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	TAL2	Q16559	108 aa		7.12	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		7.11	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	7.1	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	HSD52	Q0P140	79 aa		7.1	□□□□□ -1.27
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMIM29	Q86T20	159 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEND1	Q8N111	149 aa		7.08	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GWB2	263 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014		A6NDN8	102 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A20	O43772	301 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		7.07	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014		A4D1N5	150 aa		7.06	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014		A6NJY4	79 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014		M0R143	59 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	7.05	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		7.05	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q1RN00	199 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		7.04	□□□□□ -1.28
SH3BP2-222	ENST00000512014	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		7.03	□□□□□ -1.28

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