RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 NCR3O14931 201 aa7.07□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 MT1HL1P0DM35 61 aa7.07□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.07□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.07□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 Q8NDZ9 215 aa7.07□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.07□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.06□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 C7orf33Q8WU49 177 aa7.06□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00167Q96N53 147 aa7.06□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.05□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 A6NDN8 102 aa7.05□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 GAGE10A6NGK3 116 aa7.05□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 IGKV2D-28P01615 120 aa7.05□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 FXYD2P54710 66 aa7.05□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 UBE2BP63146 152 aa7.05□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.05□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 RAB37Q96AX2 223 aa7.05□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM126AQ9H061 195 aa7.05□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.04□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 CFC1BP0CG36 223 aa7.04□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 CFC1P0CG37 223 aa7.04□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.03□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 A0A0B4J2C4 111 aa7.03□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.03□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
UBE2B-208ENST00000511807 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.02□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.02□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV6-57P01721 117 aa7.02□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.02□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.02□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1B0GWB2 263 aa7□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 PRYO14603 147 aa7□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 BATFQ16520 125 aa7□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 REG3GQ6UW15 175 aa6.99□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 H7C2G1 150 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 Q1RN00 199 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 LINC01600Q96MT4 127 aa6.97□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.96□□□□□ -1.29
UBE2B-208ENST00000511807 K7ERJ3 54 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 VAMP3Q15836 100 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 DIRC1Q969H9 104 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.96□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 SPRR1AP35321 89 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf137Q5JT78 98 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.95□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.94□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 BCE1O60756 84 aa6.94□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 C6orf99Q4VX62 202 aa6.94□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 COX6CP09669 75 aa6.93□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 UBE2AP49459 152 aa6.93□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 PSMB2P49721 201 aa6.93□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.93□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.93□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.93□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.93□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 TSPAN13O95857 204 aa6.92□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 COX7BP24311 80 aa6.92□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.92□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 LCE3BQ5TA77 95 aa6.92□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 H0Y9J4 135 aa6.91□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 H0YGX0 51 aa6.91□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 IGLV7-43P04211 117 aa6.91□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 B5MCH6 92 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 Q6ZRX8 168 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.9□□□□□ -1.3
UBE2B-208ENST00000511807 TRIAP1O43715 76 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 SLC25A20O43772 301 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF861PO60384 105 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 SNCGO76070 127 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP10-8P60410 259 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 CDIP1Q9H305 208 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.89□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 C9orf118A6NHY6 69 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 PRLHP81277 87 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.88□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 TAX1BP3O14907 124 aa6.87□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.87□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 H3BUT2 72 aa6.86□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.86□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 LINC00575Q6W349 94 aa6.85□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.85□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1B0GX51 115 aa6.84□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 hADV29S1A0JD25 119 aa6.84□□□□□ -1.31
UBE2B-208ENST00000511807 Q9BRP9 147 aa6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms