RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 Q6ZRX8 168 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 Q9BRP9 147 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 TIMM17BO60830 172 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00483Q53H64 154 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00308Q8TCZ7 52 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.63□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 Q8NBF4 154 aa9.61□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 SPANXCQ9NY87 97 aa9.61□□□□□ -0.87
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SH3BP4-211ENST00000493436 C20orf202A1L168 122 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 OR13C6PQ8NH95 151 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-211ENST00000493436 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-211ENST00000493436 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-211ENST00000493436 ATOH7Q8N100 152 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-211ENST00000493436 SPINK1P00995 79 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-211ENST00000493436 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.54□□□□□ -0.88
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SH3BP4-211ENST00000493436 CDIP1Q9H305 208 aa9.54□□□□□ -0.88
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP4-211ENST00000493436 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa9.52□□□□□ -0.89
SH3BP4-211ENST00000493436 AKR1D1P51857 326 aa9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-211ENST00000493436 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SH3BP4-211ENST00000493436 C5orf52A6NGY3 159 aa9.5□□□□□ -0.89
SH3BP4-211ENST00000493436 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.5□□□□□ -0.89
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SH3BP4-211ENST00000493436 COPS9Q8WXC6 57 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-211ENST00000493436 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP4-211ENST00000493436 IFITM1P13164 125 aa9.48□□□□□ -0.89
SH3BP4-211ENST00000493436 COX7BP24311 80 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-211ENST00000493436 C6orf99Q4VX62 202 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-211ENST00000493436 Q6ZVH6 145 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP4-211ENST00000493436 MUC2Q02817 5179 aa9.46□□□□□ -0.89
SH3BP4-211ENST00000493436 S100A1P23297 94 aa9.46□□□□□ -0.9
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SH3BP4-211ENST00000493436 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
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SH3BP4-211ENST00000493436 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.45□□□□□ -0.9
SH3BP4-211ENST00000493436 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.45□□□□□ -0.9
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SH3BP4-211ENST00000493436 Q8N377 158 aa9.44□□□□□ -0.9
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SH3BP4-211ENST00000493436 SLC25A20O43772 301 aa9.42□□□□□ -0.9
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SH3BP4-211ENST00000493436 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP4-211ENST00000493436 TAL2Q16559 108 aa9.39□□□□□ -0.91
SH3BP4-211ENST00000493436 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.39□□□□□ -0.91
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SH3BP4-211ENST00000493436 SCGB1D1O95968 90 aa9.31□□□□□ -0.92
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SH3BP4-211ENST00000493436 SMIM29Q86T20 159 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-211ENST00000493436 PRO1933Q9H354 126 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-211ENST00000493436 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
SH3BP4-211ENST00000493436 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.29□□□□□ -0.92
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SH3BP4-211ENST00000493436 VAMP3Q15836 100 aa9.27□□□□□ -0.93
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SH3BP4-211ENST00000493436 HIST1H4GQ99525 98 aa9.25□□□□□ -0.93
SH3BP4-211ENST00000493436 FAT4Q6V0I7 4981 aa9.25□□□□□ -0.93
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SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00575Q6W349 94 aa9.24□□□□□ -0.93
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SH3BP4-211ENST00000493436 DLEU1O43261 78 aa9.2□□□□□ -0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 Q5XG85 94 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 Q6ZQY7 126 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.19□□□□□ -0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 F8WEM9 126 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 C14orf144Q96I85 54 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 C9orf92A6NGG3 77 aa9.17□□□□□ -0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.17□□□□□ -0.94
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