RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492076.1

SLC20A1-208, Transcript of solute carrier family 20 member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SLC20A1, Length 613 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC20A1-208ENST00000492076 IFITM2Q01629 132 aa3.69□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 RHEBQ15382 184 aa3.69□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.69□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.69□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 MUC17Q685J3 4493 aa3.69□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.68□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.68□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 SFTA2Q6UW10 78 aa3.68□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 Q8NBF4 154 aa3.68□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.68□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 TMEM223A0PJW6 202 aa3.67□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.67□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 MOBPQ13875 183 aa3.66□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.66□□□□□ -1.82
SLC20A1-208ENST00000492076 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.65□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 APOC3P02656 99 aa3.65□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 S100A12P80511 92 aa3.65□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.65□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.64□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 HSBP1O75506 76 aa3.64□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 HERV-K104P63124 156 aa3.64□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 CTAG1AP78358 180 aa3.64□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.64□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 C10orf91Q5T1B1 145 aa3.64□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 FAM19A2Q8N3H0 131 aa3.64□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.64□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.64□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.63□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 ERC2-IT1O76042 136 aa3.63□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 SPINK1P00995 79 aa3.63□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 DDTP30046 118 aa3.63□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 SPRR1AP35321 89 aa3.63□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.63□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 NPC2P61916 151 aa3.63□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 NDUFA5Q16718 116 aa3.63□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.63□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.63□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 MIEN1Q9BRT3 115 aa3.63□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 LINC00587B1AMM8 73 aa3.62□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 SNAPINO95295 136 aa3.62□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 SVBPQ8N300 66 aa3.62□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.62□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.62□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.61□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 FABP4P15090 132 aa3.61□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.61□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 LINC00483Q53H64 154 aa3.61□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 Q8N377 158 aa3.61□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 Q9BRP9 147 aa3.61□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.6□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 LEPROTO15243 131 aa3.6□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 SLC25A20O43772 301 aa3.6□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 LEPROTL1O95214 131 aa3.6□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 HERVK_113P61574 105 aa3.6□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.6□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 Q6ZRX8 168 aa3.6□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.6□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 PRAC1Q96KF2 57 aa3.6□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.6□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 J3QQQ9 107 aa3.59□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 SERF1AO75920 110 aa3.59□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 Q6ZVQ6 151 aa3.59□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.59□□□□□ -1.83
SLC20A1-208ENST00000492076 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.58□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 DPM2O94777 84 aa3.58□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 IGKCP01834 107 aa3.58□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 TRGC2P03986 189 aa3.58□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 PLNP26678 52 aa3.58□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.58□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.58□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.58□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 YPEL4Q96NS1 127 aa3.58□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.58□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 C9orf92A6NGG3 77 aa3.57□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 IGLV6-57P01721 117 aa3.57□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.57□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.57□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.56□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 A0A0J9YXY3 114 aa3.56□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 NDUFC2O95298 119 aa3.56□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 NMUP48645 174 aa3.56□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.56□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 LITAFQ99732 161 aa3.56□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.55□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 H7C2G1 150 aa3.55□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.55□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 LIMD2Q9BT23 127 aa3.55□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 Q1RN00 199 aa3.54□□□□□ -1.84
SLC20A1-208ENST00000492076 PCOTHQ58A44 107 aa3.54□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms