RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
ATG4B-222ENST00000491867 H0Y8G0 127 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 LEPROTO15243 131 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 IGLV6-57P01721 117 aa7.46□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 NDUFA5Q16718 116 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.45□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 J3QQQ9 107 aa7.44□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 NDUFC2O95298 119 aa7.44□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 PLNP26678 52 aa7.44□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.44□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.44□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.43□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 C9orf92A6NGG3 77 aa7.43□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 NMUP48645 174 aa7.43□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 LEPROTL1O95214 131 aa7.42□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 HERVK_113P61574 105 aa7.41□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.41□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 DPM2O94777 84 aa7.4□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 LINC00310P59036 64 aa7.4□□□□□ -1.22
ATG4B-222ENST00000491867 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 SERF1AO75920 110 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.39□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 C5orf52A6NGY3 159 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 NPC2P61916 151 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.38□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 IGKCP01834 107 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 CFC1P0CG37 223 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.37□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 A0A0J9YXY3 114 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 TRGC2P03986 189 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 LIMD2Q9BT23 127 aa7.36□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 FABP4P15090 132 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 SPRR1BP22528 89 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.35□□□□□ -1.23
ATG4B-222ENST00000491867 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4B-222ENST00000491867 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4B-222ENST00000491867 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.33□□□□□ -1.24
ATG4B-222ENST00000491867 E9PLD3 99 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4B-222ENST00000491867 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4B-222ENST00000491867 SPANXCQ9NY87 97 aa7.32□□□□□ -1.24
ATG4B-222ENST00000491867 LITAFQ99732 161 aa7.31□□□□□ -1.24
ATG4B-222ENST00000491867 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-222ENST00000491867 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.3□□□□□ -1.24
ATG4B-222ENST00000491867 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.3□□□□□ -1.24
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ATG4B-222ENST00000491867 Q6Q795 121 aa7.28□□□□□ -1.24
ATG4B-222ENST00000491867 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.28□□□□□ -1.24
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ATG4B-222ENST00000491867 CD164Q04900 197 aa7.27□□□□□ -1.25
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ATG4B-222ENST00000491867 Q1RN00 199 aa7.26□□□□□ -1.25
ATG4B-222ENST00000491867 C6orf99Q4VX62 202 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG4B-222ENST00000491867 PRO1933Q9H354 126 aa7.25□□□□□ -1.25
ATG4B-222ENST00000491867 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG4B-222ENST00000491867 H7C2G1 150 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG4B-222ENST00000491867 Q5XG85 94 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG4B-222ENST00000491867 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.24□□□□□ -1.25
ATG4B-222ENST00000491867 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.23□□□□□ -1.25
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ATG4B-222ENST00000491867 TAL2Q16559 108 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4B-222ENST00000491867 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.23□□□□□ -1.25
ATG4B-222ENST00000491867 ZNF815PA8K554 130 aa7.22□□□□□ -1.25
ATG4B-222ENST00000491867 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 COLCA2A8K830 154 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 C1orf195Q5TG92 126 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.21□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 AKR1D1P51857 326 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 LINC01545Q5VT33 79 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 SMIM29Q86T20 159 aa7.2□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 A0A1B0GWB2 263 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 PET117Q6UWS5 81 aa7.18□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 A0A0G2JQZ4 141 aa7.17□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 HIST1H2BKO60814 126 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 MT2AP02795 61 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 HIST1H2BJP06899 126 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 HIST1H2BOP23527 126 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 HIST1H2BBP33778 126 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 HIST1H2BDP58876 126 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 HIST1H2BCP62807 126 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.16□□□□□ -1.26
ATG4B-222ENST00000491867 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4B-222ENST00000491867 COPS9Q8WXC6 57 aa7.14□□□□□ -1.27
ATG4B-222ENST00000491867 A6NDN8 102 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4B-222ENST00000491867 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4B-222ENST00000491867 A4D1N5 150 aa7.12□□□□□ -1.27
ATG4B-222ENST00000491867 TCL1BO95988 128 aa7.12□□□□□ -1.27
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