RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489487.1

TMEM30CP-202, Transcript of transmembrane protein 30C, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM30CP, Length 380 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30CP-202ENST00000489487 A0A0G2JND7 137 aa-2.15□□□□□ -2.75
TMEM30CP-202ENST00000489487 COX6B2Q6YFQ2 88 aa-2.15□□□□□ -2.75
TMEM30CP-202ENST00000489487 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
TMEM30CP-202ENST00000489487 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-2.15□□□□□ -2.75
TMEM30CP-202ENST00000489487 DMDP11532 3685 aa-2.15□□□□□ -2.75
TMEM30CP-202ENST00000489487 ARMS2P0C7Q2 107 aa-2.16□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 SFTA2Q6UW10 78 aa-2.16□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-2.16□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 HSD52Q0P140 79 aa-2.17□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-2.17□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 WFDC9Q8NEX5 89 aa-2.17□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 UQCR10Q9UDW1 63 aa-2.17□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 USP32Q8NFA0 1604 aa-2.17□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 VPS13CQ709C8 3753 aa-2.18□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 WIZO95785 1651 aa-2.18□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-2.18□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-2.18□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 MAGI2Q86UL8 1455 aa-2.18□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 H0Y9P7 68 aa-2.18□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 TNP1P09430 55 aa-2.18□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 PP6455Q8WZ26 134 aa-2.18□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 C5P01031 1676 aa-2.18□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-2.19□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 A2ML1A8K2U0 1454 aa-2.19□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 TOP2BQ02880 1626 aa-2.19□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP-2.19□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 SAMD9Q5K651 1589 aa-2.19□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-2.2□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 COMMD6Q7Z4G1 85 aa-2.2□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 DEFB106AQ8N104 65 aa-2.2□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 ARL11Q969Q4 196 aa-2.2□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 PSENENQ9NZ42 101 aa-2.2□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-2.2□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-2.2□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 SPEGQ15772 3267 aa-2.21□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 FOCADQ5VW36 1801 aa-2.21□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-2.21□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 C7orf77A4D0Y5 90 aa-2.21□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 FAM25AB3EWG3 89 aa-2.21□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 FAM25CB3EWG5 89 aa-2.21□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 FAM25GB3EWG6 89 aa-2.21□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 H3BQF6 201 aa-2.21□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 MT1FP04733 61 aa-2.21□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 LINC00158P58513 81 aa-2.21□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 GNGT1P63211 74 aa-2.21□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 MEIG1Q5JSS6 88 aa-2.21□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-2.22□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 C3orf79P0CE67 100 aa-2.22□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 DEFB130BP0DP73 79 aa-2.22□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 DEFB130AP0DP74 79 aa-2.22□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 Q0VG73 95 aa-2.22□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 Q56UQ5 140 aa-2.22□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 PSMG4Q5JS54 123 aa-2.22□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 PRO3102Q9H379 93 aa-2.22□□□□□ -2.76
TMEM30CP-202ENST00000489487 MYH4Q9Y623 1939 aa-2.23□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 K7EP13 123 aa-2.23□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 DEFB4AO15263 64 aa-2.23□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 TRAPPC2P0DI81 140 aa-2.23□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-2.23□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-2.23□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 PKD1L3Q7Z443 1732 aa-2.23□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-2.23□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 COX6CP09669 75 aa-2.24□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 MANBALQ9NQG1 85 aa-2.24□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 DEPDC5O75140 1603 aa-2.24□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 ABCC5O15440 1437 aa-2.25□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 FRYLO94915 3013 aa-2.25□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-2.25□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 F6UZH7 168 aa-2.25□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 ASIPP42127 132 aa-2.25□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-2.25□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 CATR1Q13166 79 aa-2.25□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 C12orf57Q99622 126 aa-2.25□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 PRO1854Q9UHT4 67 aa-2.25□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 LYNX1G3V0Z9 82 aa-2.26□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 COX7BP24311 80 aa-2.26□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 RGPD1P0DJD0 1748 aa-2.26□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 NESP48681 1621 aa-2.27□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 CHD1O14646 1710 aa-2.27□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 APOC2P02655 101 aa-2.27□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 IGLC2P0DOY2 106 aa-2.27□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 IGLC3P0DOY3 106 aa-2.27□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 GNG11P61952 73 aa-2.27□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 SELENOWP63302 87 aa-2.27□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 CENPEQ02224 2701 aa-2.27□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 LY75O60449 1722 aa-2.28□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-2.28□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-2.28□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 ATP7BP35670 1465 aa-2.28□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-2.28□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-2.28□□□□□ -2.77
TMEM30CP-202ENST00000489487 OOSP1A8MZH6 123 aa-2.29□□□□□ -2.78
TMEM30CP-202ENST00000489487 LINC00470Q9BZP3 86 aa-2.29□□□□□ -2.78
TMEM30CP-202ENST00000489487 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-2.29□□□□□ -2.78
TMEM30CP-202ENST00000489487 AP4S1Q9Y587 144 aa-2.29□□□□□ -2.78
TMEM30CP-202ENST00000489487 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-2.29□□□□□ -2.78
TMEM30CP-202ENST00000489487 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP-2.3□□□□□ -2.78
TMEM30CP-202ENST00000489487 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
TMEM30CP-202ENST00000489487 NAIPQ13075 1403 aa-2.3□□□□□ -2.78
TMEM30CP-202ENST00000489487 SCAPERQ9BY12 1400 aa-2.3□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms