RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489318.1

C9orf3-220, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-220ENST00000489318 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 C6orf99Q4VX62 202 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 UBE2V1Q13404 147 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 DIRC1Q969H9 104 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-220ENST00000489318 A0A087WYN8 130 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 ATXN8Q156A1 80 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 CLEC2BQ92478 149 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 A0A1B0GX51 115 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 TRACP01848 142 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 H3BMG7 143 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 KRTAP10-1P60331 282 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 RYR3Q15413 4870 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 PRO0461Q9UI25 63 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 COX7BP24311 80 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 REG3GQ6UW15 175 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00575Q6W349 94 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 LINC01600Q96MT4 127 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZRX8 168 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 B5MCH6 92 aa7.15□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 UBE2BP63146 152 aa7.15□□□□□ -1.26
C9orf3-220ENST00000489318 F8W1H4 67 aa7.14□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 SCXQ7RTU7 201 aa7.14□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.14□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 DPH3Q96FX2 82 aa7.14□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.13□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 C9JAW5 83 aa7.13□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 H0Y9J4 135 aa7.13□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 H3BT86 120 aa7.13□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.13□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 hADV29S1A0JD25 119 aa7.12□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 SLC25A20O43772 301 aa7.12□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 DNAL4O96015 105 aa7.12□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 SNCGO76070 127 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 Q9BRP9 147 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 BCE1O60756 84 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 MTURNQ8N3F0 131 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 PKHD1P08F94 4074 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf3-220ENST00000489318 PRLHP81277 87 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 Q6ZQY7 126 aa7.08□□□□□ -1.28
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C9orf3-220ENST00000489318 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 H3BQ85 93 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 GHRHP01286 108 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 TEN1Q86WV5 123 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 ERC2-IT1O76042 136 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 UBE2AP49459 152 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 XGP55808 180 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 HAMPP81172 84 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 ETDBQ3ZM63 59 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 C1orf137Q5JT78 98 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf3-220ENST00000489318 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf3-220ENST00000489318 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF861PO60384 105 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf3-220ENST00000489318 IGLV7-43P04211 117 aa7.01□□□□□ -1.29
C9orf3-220ENST00000489318 SPRR1BP22528 89 aa7□□□□□ -1.29
C9orf3-220ENST00000489318 Q8N377 158 aa7□□□□□ -1.29
C9orf3-220ENST00000489318 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7□□□□□ -1.29
C9orf3-220ENST00000489318 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf3-220ENST00000489318 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf3-220ENST00000489318 CDK2AP2O75956 126 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf3-220ENST00000489318 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
C9orf3-220ENST00000489318 LINC00483Q53H64 154 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf3-220ENST00000489318 SMIM29Q86T20 159 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf3-220ENST00000489318 SPRR4Q96PI1 79 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf3-220ENST00000489318 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
C9orf3-220ENST00000489318 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
C9orf3-220ENST00000489318 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf3-220ENST00000489318 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf3-220ENST00000489318 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
C9orf3-220ENST00000489318 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
C9orf3-220ENST00000489318 RYR1P21817 5038 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf3-220ENST00000489318 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf3-220ENST00000489318 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf3-220ENST00000489318 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.92□□□□□ -1.3
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