RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 F8WEM9 126 aa-1.32□□□□□ -2.62
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SENP6-210ENST00000487548 SPART-AS1P0CW21 52 aa-1.32□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 SPANXCQ9NY87 97 aa-1.32□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 PRO1854Q9UHT4 67 aa-1.32□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 SERP1Q9Y6X1 66 aa-1.32□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 CEP152O94986 1710 aa-1.32□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa-1.32□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 OVOS2Q6IE36 1432 aa-1.32□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-1.33□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 SAMD9Q5K651 1589 aa-1.33□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 FAM135AQ9P2D6 1515 aa-1.33□□□□□ -2.62
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SENP6-210ENST00000487548 LYNX1G3V0Z9 82 aa-1.33□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 S100GP29377 79 aa-1.33□□□□□ -2.62
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SENP6-210ENST00000487548 SPANXDQ9BXN6 97 aa-1.33□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 CEP350Q5VT06 3117 aa-1.33□□□□□ -2.62
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SENP6-210ENST00000487548 ANKRD36A6QL64 1941 aa-1.33□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 MYH13Q9UKX3 1938 aa-1.33□□□□□ -2.62
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SENP6-210ENST00000487548 TEX14Q8IWB6 1497 aa-1.34□□□□□ -2.62
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SENP6-210ENST00000487548 K7ERU9 68 aa-1.34□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 IGLC6P0CF74 106 aa-1.34□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 GNG11P61952 73 aa-1.34□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 Q0VG73 95 aa-1.34□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 SMCO1Q147U7 214 aa-1.34□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP-1.34□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 GINS2Q9Y248 185 aa-1.34□□□□□ -2.62
SENP6-210ENST00000487548 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-1.34□□□□□ -2.62
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SENP6-210ENST00000487548 TMEM262E9PQX1 116 aa-1.35□□□□□ -2.63
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SENP6-210ENST00000487548 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa-1.35□□□□□ -2.63
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SENP6-210ENST00000487548 M0QZ58 72 aa-1.36□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 M0R2Z0 102 aa-1.36□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 LINC00694P0DN24 101 aa-1.36□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 WT1-ASQ06250 92 aa-1.36□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 QSER1Q2KHR3 1735 aa-1.36□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 MORN2Q502X0 79 aa-1.36□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 SMIM3Q9BZL3 60 aa-1.36□□□□□ -2.63
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SENP6-210ENST00000487548 LINC00474Q9P2X8 69 aa-1.36□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 KIF20BQ96Q89 1820 aa-1.36□□□□□ -2.63
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SENP6-210ENST00000487548 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-1.36□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-1.36□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 UBR3Q6ZT12 1888 aa-1.37□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 MON2Q7Z3U7 1717 aa-1.37□□□□□ -2.63
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SENP6-210ENST00000487548 SMARCA2P51531 1590 aa-1.37□□□□□ -2.63
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SENP6-210ENST00000487548 M0QY20 66 aa-1.37□□□□□ -2.63
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SENP6-210ENST00000487548 CGREF1Q99674 301 aa-1.37□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 SPANXA1Q9NS26 97 aa-1.37□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 SHPRHQ149N8 1683 aa-1.37□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa-1.37□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 LY75O60449 1722 aa-1.37□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 TSTD3H0UI37 97 aa-1.38□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 FABP1P07148 127 aa-1.38□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP-1.38□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 COPZ1P61923 177 aa-1.38□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 CATR1Q13166 79 aa-1.38□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 PMCHL1Q16048 86 aa-1.38□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 PFDN5Q99471 154 aa-1.38□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 AIF1LQ9BQI0 150 aa-1.38□□□□□ -2.63
SENP6-210ENST00000487548 HSPB11Q9Y547 144 aa-1.38□□□□□ -2.63
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