RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480420.5

CTPS1-209, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene CTPS1, Length 750 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-209ENST00000480420 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.61□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 SPRR1AP35321 89 aa4.61□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 TPRXLQ17RH7 258 aa4.61□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.61□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.61□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.6□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 Q6ZRX8 168 aa4.6□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 Q9BRP9 147 aa4.6□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF815PA8K554 130 aa4.59□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 E9PLD3 99 aa4.59□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.59□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 SPINK1P00995 79 aa4.59□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.59□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.59□□□□□ -1.67
CTPS1-209ENST00000480420 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.58□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 NDUFC2O95298 119 aa4.58□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 IGLV6-57P01721 117 aa4.58□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 KRTDAPP60985 99 aa4.58□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00483Q53H64 154 aa4.58□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.58□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.58□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 HIST1H2BKO60814 126 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 HIST1H2BJP06899 126 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 HIST1H2BOP23527 126 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 HIST1H2BBP33778 126 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 HIST1H2BDP58876 126 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 HIST1H2BCP62807 126 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.57□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 CTAG1AP78358 180 aa4.56□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 SPANXCQ9NY87 97 aa4.56□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 CBY1Q9Y3M2 126 aa4.56□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A20O43772 301 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 TAL2Q16559 108 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 PET117Q6UWS5 81 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 ATOH7Q8N100 152 aa4.55□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 A6NDN8 102 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 C3orf79P0CE67 100 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 COX7BP24311 80 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 Q1RN00 199 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 LCE3BQ5TA77 95 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 LINC01545Q5VT33 79 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 Q8N377 158 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.54□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 C20orf202A1L168 122 aa4.53□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 C6orf99Q4VX62 202 aa4.53□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 SLC25A34Q6PIV7 304 aa4.53□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 LITAFQ99732 161 aa4.53□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.53□□□□□ -1.68
CTPS1-209ENST00000480420 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.52□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 H7C2G1 150 aa4.52□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 TIMM17BO60830 172 aa4.52□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.52□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.52□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 C9orf92A6NGG3 77 aa4.51□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.51□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 ANKRD39Q53RE8 183 aa4.5□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 COPS9Q8WXC6 57 aa4.5□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 LIMD2Q9BT23 127 aa4.5□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.49□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 PCP2Q8IVA1 136 aa4.49□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 MUSTN1Q8IVN3 82 aa4.49□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 A0A0G2JQZ4 141 aa4.48□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.48□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 C5orf52A6NGY3 159 aa4.48□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 S100A2P29034 98 aa4.47□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.47□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.47□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 PRO1933Q9H354 126 aa4.47□□□□□ -1.69
CTPS1-209ENST00000480420 A0A1B0GWB2 263 aa4.46□□□□□ -1.7
CTPS1-209ENST00000480420 IFITM1P13164 125 aa4.46□□□□□ -1.7
CTPS1-209ENST00000480420 SPRR1BP22528 89 aa4.46□□□□□ -1.7
CTPS1-209ENST00000480420 AKR1D1P51857 326 aa4.46□□□□□ -1.7
CTPS1-209ENST00000480420 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.46□□□□□ -1.7
CTPS1-209ENST00000480420 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.45□□□□□ -1.7
CTPS1-209ENST00000480420 PCOTHQ58A44 107 aa4.45□□□□□ -1.7
CTPS1-209ENST00000480420 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
CTPS1-209ENST00000480420 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.44□□□□□ -1.7
CTPS1-209ENST00000480420 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.44□□□□□ -1.7
CTPS1-209ENST00000480420 F8WEM9 126 aa4.44□□□□□ -1.7
CTPS1-209ENST00000480420 VAMP3Q15836 100 aa4.44□□□□□ -1.7
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