RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 J3QR89 54 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 M0QXV9 152 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 IFITM1P13164 125 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 NPC2P61916 151 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 MTURNQ8N3F0 131 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.69□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 NDUFC2O95298 119 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 HSD52Q0P140 79 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 COPS9Q8WXC6 57 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 HIGD1BQ9P298 99 aa6.68□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 M0R378 163 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 C7orf33Q8WU49 177 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC00167Q96N53 147 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 NCR3O14931 201 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 UBE2BP63146 152 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 HIST1H4GQ99525 98 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 SIGMAR1Q99720 223 aa6.65□□□□□ -1.34
SH3BP1-207ENST00000471650 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 FABP2P12104 132 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A1W2PPM0 123 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 IGKV2D-28P01615 120 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 TAL2Q16559 108 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.63□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 A4D1N5 150 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 H3BUT2 72 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 IGLV6-57P01721 117 aa6.61□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 CEND1Q8N111 149 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 A6NJY4 79 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 F8W1H4 67 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 C1orf137Q5JT78 98 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 TMEM126AQ9H061 195 aa6.59□□□□□ -1.35
SH3BP1-207ENST00000471650 PRYO14603 147 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 REG3GQ6UW15 175 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.58□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 BCE1O60756 84 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 IGLV7-43P04211 117 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 CFC1BP0CG36 223 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 CFC1P0CG37 223 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 SPRR1AP35321 89 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 FXYD2P54710 66 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.56□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A0B4J2C4 111 aa6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF861PO60384 105 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 RAB37Q96AX2 223 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A0U1RQV1 116 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 H0Y9J4 135 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 RPL28P46779 137 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 UBE2AP49459 152 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.52□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 A0A1B0GWB2 263 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 B5MCH6 92 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 DIRC1Q969H9 104 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 TSPAN13O95857 204 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 PRLHP81277 87 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 C6orf99Q4VX62 202 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.5□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 Q6ZRX8 168 aa6.49□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 H3BMG7 143 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 H7C2G1 150 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 K7ERJ3 54 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 COX7BP24311 80 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.47□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SH3BP1-207ENST00000471650 Q9BRP9 147 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP1-207ENST00000471650 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP1-207ENST00000471650 PRO0461Q9UI25 63 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP1-207ENST00000471650 Q1RN00 199 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1-207ENST00000471650 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP1-207ENST00000471650 ETDBQ3ZM63 59 aa6.44□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms