RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460808.5

TGFA-208, Transcript of transforming growth factor alpha, humanhuman

TSL 4

Gene TGFA, Length 470 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFA-208ENST00000460808 ERC2-IT1O76042 136 aa6.88□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 TSPAN13O95857 204 aa6.88□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 Q6ZRX8 168 aa6.88□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.88□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.88□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 ZNF815PA8K554 130 aa6.87□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.87□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.87□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.86□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.86□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 NPC2P61916 151 aa6.86□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 SPANXCQ9NY87 97 aa6.86□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 ATOH7Q8N100 152 aa6.85□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 MUC17Q685J3 4493 aa6.85□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 PRR4Q16378 134 aa6.84□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 Q6ZVH6 145 aa6.84□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.84□□□□□ -1.31
TGFA-208ENST00000460808 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.83□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 SCGB1D1O95968 90 aa6.83□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 S100A12P80511 92 aa6.83□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.83□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 COPS9Q8WXC6 57 aa6.83□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.83□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.82□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 PCP2Q8IVA1 136 aa6.81□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.81□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.81□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 IFITM1P13164 125 aa6.8□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.8□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.79□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.79□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 Q8NBF4 154 aa6.79□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 SPRR1BP22528 89 aa6.78□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 TPRXLQ17RH7 258 aa6.78□□□□□ -1.32
TGFA-208ENST00000460808 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.77□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 DLEU1O43261 78 aa6.76□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.76□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 SPINK1P00995 79 aa6.75□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 COX8AP10176 69 aa6.75□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.74□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.74□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 MOBPQ13875 183 aa6.74□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 C6orf99Q4VX62 202 aa6.74□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.74□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.74□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 VAMP8Q9BV40 100 aa6.74□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.72□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 SPATA45Q537H7 98 aa6.72□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 Q8N377 158 aa6.72□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.72□□□□□ -1.33
TGFA-208ENST00000460808 COX7BP24311 80 aa6.7□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.7□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 PYY3Q5JQD4 70 aa6.7□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 HIGD1BQ9P298 99 aa6.7□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.7□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.69□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.69□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.69□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.69□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.68□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 SMIM29Q86T20 159 aa6.68□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 C14orf144Q96I85 54 aa6.68□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 A0A1B0GWB2 263 aa6.67□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.67□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 HIST1H4GQ99525 98 aa6.67□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 A6NDN8 102 aa6.66□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 A4D1N5 150 aa6.65□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 TAL2Q16559 108 aa6.65□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 CDIP1Q9H305 208 aa6.65□□□□□ -1.34
TGFA-208ENST00000460808 SLC25A20O43772 301 aa6.64□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.64□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.63□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.62□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.62□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 CD164Q04900 197 aa6.61□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 Q1RN00 199 aa6.61□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.6□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 A6NJY4 79 aa6.6□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 VAMP3Q15836 100 aa6.6□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 Q5XG85 94 aa6.6□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 LINC00575Q6W349 94 aa6.6□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 CEND1Q8N111 149 aa6.6□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 A0A0B4J2C4 111 aa6.59□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.59□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.59□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.59□□□□□ -1.35
TGFA-208ENST00000460808 PRO1933Q9H354 126 aa6.58□□□□□ -1.36
TGFA-208ENST00000460808 CFC1BP0CG36 223 aa6.57□□□□□ -1.36
TGFA-208ENST00000460808 CFC1P0CG37 223 aa6.57□□□□□ -1.36
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