RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455134.1

GAPDHP28-201, Transcript of glyceraldehyde 3 phosphate dehydrogenase pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene GAPDHP28, Length 1,003 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00483Q53H64 154 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 BOD1L2Q8IYS8 172 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q8NBF4 154 aa4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 ERC2-IT1O76042 136 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 ARL17AQ8IVW1 177 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 FAM19A2Q8N3H0 131 aa4.75□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 B5MCH6 92 aa4.74□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.74□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q9BRP9 147 aa4.74□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.74□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 HERV-K104P63124 156 aa4.73□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.73□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.73□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 SVBPQ8N300 66 aa4.72□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q8N377 158 aa4.72□□□□□ -1.65
GAPDHP28-201ENST00000455134 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 LEPROTO15243 131 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSBP1O75506 76 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPINK1P00995 79 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa4.71□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A1B0GV90 55 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 DDTP30046 118 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 MOBPQ13875 183 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 Q6ZRX8 168 aa4.7□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.69□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 TSTD3H0UI37 97 aa4.69□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 SERF1AO75920 110 aa4.69□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGLV6-57P01721 117 aa4.69□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRGC2P03986 189 aa4.69□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.69□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 PMCHL2Q9BQD1 86 aa4.69□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 J3QQQ9 107 aa4.68□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 LEPROTL1O95214 131 aa4.68□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.68□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.68□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.68□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 DLEU1O43261 78 aa4.67□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 NDUFC2O95298 119 aa4.67□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 A0A0J9YXY3 114 aa4.66□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 DPM2O94777 84 aa4.66□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 NPC2P61916 151 aa4.66□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.66□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 LITAFQ99732 161 aa4.66□□□□□ -1.66
GAPDHP28-201ENST00000455134 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.65□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 IGKCP01834 107 aa4.65□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 FABP4P15090 132 aa4.65□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 PLNP26678 52 aa4.65□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 NMUP48645 174 aa4.65□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 SLC25A20O43772 301 aa4.64□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 COLCA2A8K830 154 aa4.63□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 E9PLD3 99 aa4.63□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPRR1BP22528 89 aa4.63□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 MIEN1Q9BRT3 115 aa4.63□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 HERVK_113P61574 105 aa4.62□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 S100A7L2Q5SY68 101 aa4.62□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.62□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 C14orf144Q96I85 54 aa4.62□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 HSPB8Q9UJY1 196 aa4.62□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 V9GYY9 64 aa4.62□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 AKR1D1P51857 326 aa4.61□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.61□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.6□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.6□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.6□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 SPANXCQ9NY87 97 aa4.6□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.59□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 MT1HP80294 61 aa4.59□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.59□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 LINC01545Q5VT33 79 aa4.59□□□□□ -1.67
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST1H2BKO60814 126 aa4.58□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 TIMM17BO60830 172 aa4.58□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST1H2BJP06899 126 aa4.58□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST1H2BOP23527 126 aa4.58□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST1H2BBP33778 126 aa4.58□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST1H2BDP58876 126 aa4.58□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST1H2BCP62807 126 aa4.58□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.58□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.58□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.58□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.58□□□□□ -1.68
GAPDHP28-201ENST00000455134 H3BS24 57 aa4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms