RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 SCGB1D1O95968 90 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.99□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 B5MCH6 92 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 PYY3Q5JQD4 70 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 ATOH7Q8N100 152 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.98□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
PRAME-209ENST00000439106 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.97□□□□□ -1.13
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PRAME-209ENST00000439106 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
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PRAME-209ENST00000439106 S100A12P80511 92 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-209ENST00000439106 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-209ENST00000439106 LITAFQ99732 161 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-209ENST00000439106 Q9BRP9 147 aa7.95□□□□□ -1.14
PRAME-209ENST00000439106 NDUFC2O95298 119 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-209ENST00000439106 IGLV6-57P01721 117 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-209ENST00000439106 Q8NBF4 154 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-209ENST00000439106 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.93□□□□□ -1.14
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZRX8 168 aa7.93□□□□□ -1.14
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PRAME-209ENST00000439106 ZNF815PA8K554 130 aa7.92□□□□□ -1.14
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PRAME-209ENST00000439106 LINC00483Q53H64 154 aa7.92□□□□□ -1.14
PRAME-209ENST00000439106 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.92□□□□□ -1.14
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PRAME-209ENST00000439106 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.9□□□□□ -1.14
PRAME-209ENST00000439106 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
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PRAME-209ENST00000439106 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-209ENST00000439106 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.88□□□□□ -1.15
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PRAME-209ENST00000439106 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-209ENST00000439106 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.88□□□□□ -1.15
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PRAME-209ENST00000439106 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-209ENST00000439106 TIMM17BO60830 172 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-209ENST00000439106 TPRXLQ17RH7 258 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-209ENST00000439106 SPATA45Q537H7 98 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-209ENST00000439106 CDIP1Q9H305 208 aa7.87□□□□□ -1.15
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PRAME-209ENST00000439106 C12orf57Q99622 126 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-209ENST00000439106 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-209ENST00000439106 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-209ENST00000439106 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-209ENST00000439106 PCP2Q8IVA1 136 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-209ENST00000439106 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.84□□□□□ -1.15
PRAME-209ENST00000439106 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-209ENST00000439106 SPINK1P00995 79 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-209ENST00000439106 COX8AP10176 69 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-209ENST00000439106 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PRAME-209ENST00000439106 C14orf144Q96I85 54 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-209ENST00000439106 C6orf99Q4VX62 202 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-209ENST00000439106 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-209ENST00000439106 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
PRAME-209ENST00000439106 Q8N377 158 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-209ENST00000439106 PRO1933Q9H354 126 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-209ENST00000439106 DLEU1O43261 78 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-209ENST00000439106 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.78□□□□□ -1.16
PRAME-209ENST00000439106 COX7BP24311 80 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 A6NDN8 102 aa7.75□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 SPRR1BP22528 89 aa7.75□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.75□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 SLC25A20O43772 301 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 IFITM1P13164 125 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 Q1RN00 199 aa7.73□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 A0A0U1RQV1 116 aa7.72□□□□□ -1.17
PRAME-209ENST00000439106 TSTD3H0UI37 97 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 TAL2Q16559 108 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 Q6ZVH6 145 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 COPS9Q8WXC6 57 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 HIGD1BQ9P298 99 aa7.71□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 A0A1B0GWB2 263 aa7.7□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.7□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.69□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.69□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 A0A0G2JQZ4 141 aa7.68□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.68□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.67□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 SMIM29Q86T20 159 aa7.67□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.67□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.66□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 H7C2G1 150 aa7.66□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.66□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 A4D1N5 150 aa7.65□□□□□ -1.18
PRAME-209ENST00000439106 HIST1H4GQ99525 98 aa7.65□□□□□ -1.18
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